EKLF/KLF1 协调维持终末红细胞生成完整性的特异性转录网络

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE338783

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

红系Krüppel样因子（EKLF/KLF1）是一种C2H2锌指转录因子，在红细胞生成的各个方面发挥关键作用。KLF1突变可导致从轻度到重度贫血的多种表型。携带杂合E325K突变（CDA IV型）的患者表现为红系终末分化受损及双核红系祖细胞增多。我们此前已证明，KLF1是小鼠原代细胞退出细胞周期和去核所必需的。在本研究中，我们发现参与细胞运动、细胞分裂和有丝分裂通路的基因均直接受KLF1调控。Klf1-/-细胞表现出双核红系祖细胞和DNA桥数量增加，且分化中的Klf1-/-红系祖细胞显示胞质分裂失败事件比例增加及微管成束缺陷。Klf1-/-红系祖细胞频繁产生异常的富含F-肌动蛋白的膜突起和无核细胞碎片。人CDA IV型细胞表现出相似的胞质分裂和细胞运动基因失调模式。

总体而言，我们的研究表明，KLF1通过直接调控终末红细胞分化过程中参与胞质分裂和运动通路的基因，对维持红细胞分裂的完整性是必需的。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。