circTEX2与EZH2敲低HUDEP-2红系祖细胞的RNA-seq表达谱
研究围绕METTL3/circTEX2/miR-137/EZH2调控轴与gamma-globin表达及红细胞生成的关系,旨在刻画circTEX2或EZH2缺失引起的转录组变化,并识别与gamma-globin调控、红系分化、细胞周期控制、凋亡及应激反应通路相关的下游基因网络,可用于差异表达与通路分析

基本信息
资源简介
circTEX2与EZH2敲低HUDEP-2红系祖细胞的RNA-seq表达谱
RNA-seq profiling of circTEX2- and EZH2-knockdown HUDEP-2 erythroid progenitor cells
本数据集为HUDEP-2红系祖细胞在慢病毒敲低circTEX2或EZH2后的bulk RNA测序表达谱,以非靶向shRNA为对照,包含1个文件GSE337367_series_matrix.txt.gz。研究围绕METTL3/circTEX2/miR-137/EZH2调控轴与gamma-globin表达及红细胞生成的关系,旨在刻画circTEX2或EZH2缺失引起的转录组变化,并识别与gamma-globin调控、红系分化、细胞周期控制、凋亡及应激反应通路相关的下游基因网络,可用于差异表达与通路分析(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jul 02 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):Beta-thalassemia由beta-globin合成缺陷引起,通过gamma-globin表达重新激活胎儿血红蛋白(HbF)是主要的代偿机制。本研究探讨了METTL3/circTEX2/miR-137/EZH2调控轴在gamma-globin表达和红细胞生成中的作用。在慢病毒敲低circTEX2或EZH2的HUDEP-2红系祖细胞中进行了bulk RNA测序,以非靶向shRNA作为对照。该数据集旨在确定circTEX2或EZH2缺失引起的转录组变化,并识别与gamma-globin调控、红系分化、细胞周期控制、凋亡和应激反应通路相关的下游基因网络。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:血液及造血器官疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE337367
【使用注意】
· 源站最后修改于 Oct 03 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
β-地中海贫血由β-珠蛋白合成缺陷引起,通过γ-珠蛋白表达重新激活胎儿血红蛋白(HbF)是一种主要的代偿机制。本研究探讨了METTL3/circTEX2/miR-137/EZH2调控轴在γ-珠蛋白表达和红细胞生成中的作用。在慢病毒敲低circTEX2或EZH2后,对HUDEP-2红系祖细胞进行bulk RNA测序,以非靶向shRNA作为对照。该数据集的生成旨在明确由circTEX2或EZH2缺失引起的转录组变化,并鉴定与γ-珠蛋白调控、红系分化、细胞周期控制、凋亡及应激反应通路相关的下游基因网络。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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