UT-7 WT与BCL11A基因增强子区磷酸位点替换细胞5-hmCSeal信号差异数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE319295

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

异基因血液干细胞移植是镰状细胞病唯一持久的治愈方法。靶向胎儿血红蛋白基因（HBG）表达抑制蛋白的非细胞疗法将为新型疗法提供基础。在此，我们将TET2双加氧酶鉴定为HBG抑制因子BCL11A以及HBG激活因子HBBP1和BGLT3长链非编码RNA的统一调控因子。通过替换单个C端磷酸酪氨酸残基下调TET2功能，足以激活HBG，其机制涉及TET2与转录因子GATA1结合的丧失以及BCL11A增强子和HBBP1/BGLT3基因中DNA羟甲基化的重新分布。通过在Tet2磷酸酪氨酸缺失背景中构建转基因镰状细胞小鼠，我们证明胎儿血红蛋白被重新激活，贫血得到改善，镰状细胞形态消失，血细胞计数恢复正常，从而确定了一种无需基因编辑方法即可激活HBG的机制。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。