营养基因组学分析鉴定 ZIP10 (SLC39A10) 为红系锌稳态调节因子及其与贫血风险的遗传关联 II

该数据集来自 NCBI GEO,包含 G1E-ER4 红系祖细胞在 β-雌二醇诱导分化条件下,经 50 µM DTPA(锌螯合剂)处理 24 小时后的基因表达谱数据,并设未诱导分化的对照组

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基因组预测GPL2424710090
GSE310207: Nutrigenomic profiling identifies ZIP10 (SLC39A10) as a regulator of erythroid zinc homeostasis with genetic associations to anemia risk II

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

营养基因组学分析鉴定 ZIP10 (SLC39A10) 为红系锌稳态调节因子及其与贫血风险的遗传关联 II

Nutrigenomic profiling identifies ZIP10 (SLC39A10) as a regulator of erythroid zinc homeostasis with genetic associations to anemia risk II

该数据集来自 NCBI GEO,包含 G1E-ER4 红系祖细胞在 β-雌二醇诱导分化条件下,经 50 µM DTPA(锌螯合剂)处理 24 小时后的基因表达谱数据,并设未诱导分化的对照组。数据通过高通量测序进行表达谱分析,平台为 GPL24247,物种为小鼠(10090)。该数据可用于研究锌缺乏对红系祖细胞转录组的影响,鉴定 ZIP10 (SLC39A10) 在红系锌稳态中的调控作用,并探索其与贫血风险的遗传关联(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Nov 17 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):为确定锌在红系祖细胞中的生理作用,在分化的 G1E-ER4 细胞中通过 50 µM DTPA(一种锌螯合剂)处理 24 小时限制细胞锌。经 β-雌二醇诱导分化的 G1E-ER4 细胞分为两组:对照组和 50 µM DTPA 处理组。还纳入了一个未经 β-雌二醇处理的细胞样本作为未分化组。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24247、10090。本站分类:血液及造血器官疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE310207

【使用注意】

· 源站最后修改于 Feb 19 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

为确定锌在红系祖细胞中的生理作用,我们在分化的G1E-ER4细胞中通过50 µM DTPA(一种锌螯合剂)处理24小时来限制细胞内的锌。由β-雌二醇诱导分化的G1E-ER4细胞被分为两组:对照组和50 µM DTPA处理组。同时,还纳入了一份未经β-雌二醇处理的细胞样本作为未分化组。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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