营养基因组学分析鉴定ZIP10(SLC39A10)为红系锌稳态调节因子及其与贫血风险的遗传关联 I

该数据集来自NCBI GEO,包含G1E-ER4红系祖细胞在血红素合成抑制条件下的RNA-seq转录组表达谱。实验分为未处理对照、50 µM DTPA(锌螯合剂)、50 µM DFO(铁螯合剂)和0.2 mM琥珀酰丙酮(SA,ALAD抑制剂)四组,处理24小时

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基因组分类GPL2424710090
GSE310206: Nutrigenomic profiling identifies ZIP10 (SLC39A10) as a regulator of erythroid zinc homeostasis with genetic associations to anemia risk I

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

营养基因组学分析鉴定ZIP10(SLC39A10)为红系锌稳态调节因子及其与贫血风险的遗传关联 I

Nutrigenomic profiling identifies ZIP10 (SLC39A10) as a regulator of erythroid zinc homeostasis with genetic associations to anemia risk I

该数据集来自NCBI GEO,包含G1E-ER4红系祖细胞在血红素合成抑制条件下的RNA-seq转录组表达谱。实验分为未处理对照、50 µM DTPA(锌螯合剂)、50 µM DFO(铁螯合剂)和0.2 mM琥珀酰丙酮(SA,ALAD抑制剂)四组,处理24小时。数据可用于比较不同通路抑制血红素合成后的基因表达差异,研究ZIP10(SLC39A10)在红系锌稳态调控中的作用及其与贫血风险的遗传关联(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Nov 17 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):为确定通过不同途径抑制血红素合成对红系祖细胞的影响,在分化的G1E-ER4细胞中用50 µM DTPA处理(一种锌螯合剂)、50 µM DFO处理(一种铁螯合剂)或0.2 mM琥珀酰丙酮(SA,一种ALAD抑制剂)抑制血红素合成24小时。G1E-ER4细胞分为四组:未处理对照、50 µM DTPA处理、50 µM DFO处理和0.2 mM SA。将RNA-seq获得的转录组谱与对照细胞进行比较。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24247、10090。本站分类:血液及造血器官疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE310206

【使用注意】

· 源站最后修改于 Feb 19 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

为确定红系祖细胞中不同途径抑制血红素合成的效应,在分化的G1E-ER4细胞中分别通过50 µM DTPA处理(一种锌螯合剂)、50 µM DFO处理(一种铁螯合剂)或0.2 mM琥珀酰丙酮(SA,一种ALAD抑制剂)抑制血红素合成24小时。G1E-ER4细胞分为四组:未处理对照组、50 µM DTPA处理组、50 µM DFO处理组和0.2 mM SA组。将RNA-seq获得的转录组谱与对照细胞进行比较。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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