核糖体亚基RPS19和RPL5对胎儿造血的非传统调控

研究以Diamond-Blackfan贫血为模型,构建Rpl5和Rps19单倍剂量不足小鼠模型,发现Rpl5单倍剂量不足导致红系翻译减少和产前致死,Rps19单倍剂量不足引起新生儿干细胞耗竭和红系祖细胞扩增受损,并涉及RUNX1上调

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蛋白质预测OtherGPL3429010090
GSE304205: Unconventional Control of Fetal Hematopoiesis by Ribosomal Subunits RPS19 and RPL5

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

核糖体亚基RPS19和RPL5对胎儿造血的非传统调控

Unconventional Control of Fetal Hematopoiesis by Ribosomal Subunits RPS19 and RPL5

该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件(GSE304205_series_matrix.txt.gz),围绕核糖体蛋白亚基RPS19和RPL5在胎儿造血中的调控作用。研究以Diamond-Blackfan贫血为模型,构建Rpl5和Rps19单倍剂量不足小鼠模型,发现Rpl5单倍剂量不足导致红系翻译减少和产前致死,Rps19单倍剂量不足引起新生儿干细胞耗竭和红系祖细胞扩增受损,并涉及RUNX1上调。数据可用于研究核糖体病相关贫血的亚基特异性机制及造血调控预测分析(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jul 31 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):核糖体病与贫血相关;然而,红细胞发育过程中核糖体蛋白(RP)化学计量和活性的精确控制仍不清楚。以Diamond-Blackfan贫血(DBA)为模型,我们生成了新的RP单倍剂量不足体内模型,以确定小和大RP亚基在胎儿造血中的作用。Rpl5单倍剂量不足因红系翻译减少而导致产前致死。相反,Rps19单倍剂量不足导致新生儿干细胞耗竭和红系祖细胞扩增受损,这是由翻译和转录缺陷共同造成的。干细胞因子RUNX1在RPS19单倍剂量不足的DBA患者中上调,其缺失部分挽救了Rps19突变小鼠的造血。我们的发现揭示了RP在胎儿造血中不同的、亚基特异性的作用,并证明失衡的

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Other、GPL34290、10090。本站分类:血液及造血器官疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE304205

【使用注意】

· 源站最后修改于 Mar 05 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

核糖体病与贫血相关;然而,红细胞发育过程中核糖体蛋白(RP)化学计量和活性的精确调控仍不清楚。以戴蒙德-布莱克凡贫血(DBA)为模型,我们构建了新型的RP单倍剂量不足体内模型,以明确小和大RP亚基在胎儿造血中的作用。Rpl5单倍剂量不足因红细胞翻译减少而导致产前死亡。相反,Rps19单倍剂量不足导致新生儿干细胞耗竭和红系祖细胞扩增受损,这是由翻译和转录缺陷共同造成的。在RPS19单倍剂量不足的DBA患者中,干细胞因子RUNX1上调,而其缺失部分挽救了Rps19突变小鼠的造血。我们的发现揭示了RP在胎儿造血中具有不同的亚基特异性作用,并证明RP化学计量失衡会破坏发育程序,为DBA发病机制和患者异质性提供了关键见解,同时强调了平衡的RP表达在干细胞和红系祖细胞发育中的重要性。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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