GSE302344:核糖体亚基RPS19和RPL5对胎儿造血的非常规调控
研究以Diamond-Blackfan贫血为模型,构建核糖体蛋白单倍剂量不足的体内模型,探究小亚基RPS19和大亚基RPL5在胎儿造血中的不同作用,涉及红系翻译、干细胞耗竭及RUNX1调控等机制

基本信息
资源简介
GSE302344:核糖体亚基RPS19和RPL5对胎儿造血的非常规调控
Unconventional Control of Fetal Hematopoiesis by Ribosomal Subunits RPS19 and RPL5
该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件GSE302344_series_matrix.txt.gz,主题为高通量测序的基因组结合/占据谱分析,物种为小鼠(10090),平台GPL24247。研究以Diamond-Blackfan贫血为模型,构建核糖体蛋白单倍剂量不足的体内模型,探究小亚基RPS19和大亚基RPL5在胎儿造血中的不同作用,涉及红系翻译、干细胞耗竭及RUNX1调控等机制。数据可用于血液及造血器官疾病相关研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jul 11 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):核糖体病与贫血相关;然而,红细胞发育过程中核糖体蛋白(RP)化学计量和活性的精确控制仍不清楚。以Diamond-Blackfan贫血(DBA)为模型,我们生成了新的RP单倍剂量不足体内模型,以确定小亚基和大亚基RP在胎儿造血中的作用。Rpl5单倍剂量不足因红系翻译减少而导致产前致死。相反,Rps19单倍剂量不足导致新生儿干细胞耗竭和红系祖细胞扩增受损,这是由翻译和转录缺陷共同导致的。干细胞因子RUNX1在RPS19单倍剂量不足的DBA患者中上调,其缺失部分挽救了Rps19突变小鼠的造血。我们的发现揭示了RP在胎儿造血中不同的、亚基特异性的作用,并证明失衡的
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24247、10090。本站分类:血液及造血器官疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE302344
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jun 26 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
核糖体病与贫血相关;然而,红细胞发育过程中核糖体蛋白(RP)化学计量和活性的精确调控仍不清楚。以戴蒙德-布莱克凡贫血(DBA)为模型,我们构建了新型的RP单倍剂量不足体内模型,以明确小亚基和大亚基RP在胎期造血中的作用。Rpl5单倍剂量不足因红细胞翻译减少而导致产前死亡。相反,Rps19单倍剂量不足导致新生儿干细胞耗竭和红系祖细胞扩增受损,这是由翻译和转录缺陷共同所致。在RPS19单倍剂量不足的DBA患者中,干细胞因子RUNX1表达上调,而敲除RUNX1可部分挽救Rps19突变小鼠的造血。我们的研究结果揭示了RP在胎期造血中具有不同的、亚基特异性的作用,并证明RP化学计量失衡会破坏发育程序,为DBA发病机制和患者异质性提供了关键见解,同时强调了平衡的RP表达在干细胞和红系祖细胞发育中的重要性。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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