GSE298941:新型DNMT1抑制剂改善β-地中海贫血疗效的发现[ATAC-seq]
该数据集来自NCBI GEO,包含1个ATAC-seq样本矩阵文件,用于研究新型非核苷类DNMT1抑制剂DMT207在β-地中海贫血治疗中的作用
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基本信息
资源简介
GSE298941:新型DNMT1抑制剂改善β-地中海贫血疗效的发现[ATAC-seq]
Discovery of a Novel DNMT1 Inhibitor with Improved Efficacy in Treating β-Thalassemia [ATAC-seq]
该数据集来自NCBI GEO,包含1个ATAC-seq样本矩阵文件,用于研究新型非核苷类DNMT1抑制剂DMT207在β-地中海贫血治疗中的作用。数据覆盖HUDEP-2细胞、成人原代红系祖细胞及β-地中海贫血小鼠模型,通过ATAC-seq分析DMT207处理后的染色质可及性变化,结合多组学揭示γ-珠蛋白为敏感响应基因。数据可用于探索DNMT1抑制剂诱导胎儿血红蛋白表达的调控机制及β-地中海贫血的表观遗传治疗研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jun 04 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):β-地中海贫血是一种隐性遗传病,影响全球数百万人。药理学诱导胎儿血红蛋白(HbF)是管理β-地中海贫血的有效治疗策略。DNA甲基转移酶抑制剂是有效的HbF诱导剂,但目前尚未被批准用于β-地中海贫血治疗。在此我们报告,新开发的非核苷类DNMT1抑制剂DMT207在HUDEP-2细胞和成人原代红系祖细胞中强烈重新激活HbF表达,且毒性极小。此外,在β-地中海贫血小鼠模型中,给予DMT207有效诱导小鼠胎儿型和胚胎型血红蛋白的表达,促进红系细胞成熟,并缓解小鼠的脾肿大。进一步的多组学研究揭示γ-珠蛋白是响应DMT207治疗的最敏感基因之一。机制上
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:血液及造血器官疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE298941
【使用注意】
· 源站最后修改于 Mar 05 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
β-地中海贫血是一种隐性遗传病,影响全球数百万人。药物诱导胎儿血红蛋白(HbF)是管理β-地中海贫血的有效治疗策略。DNA甲基转移酶抑制剂是有效的HbF诱导剂,但目前尚未被批准用于β-地中海贫血的治疗。在此,我们报告新开发的非核苷类DNMT1抑制剂DMT207能以最低毒性强烈重新激活HUDEP-2细胞和成人原代红系母细胞中HbF的表达。此外,在β-地中海贫血小鼠模型中,给予DMT207可有效诱导小鼠胎儿型和胚胎型血红蛋白的表达,促进红系细胞成熟,并缓解小鼠的脾肿大。进一步的多组学研究揭示γ-珠蛋白是响应DMT207治疗最敏感的基因之一。在机制上,DMT207通过将DNMT1捕获为开放构象来抑制DNMT1酶活性,同时增强构象扭曲的DNMT1与UHRF1之间的相互作用,部分促成了DNMT1的特异性降解。
因此,我们得出结论:DMT207是一种有前景的新型DNMT1抑制剂,可能使β-地中海贫血患者获益。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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