脓毒症患者全血细胞转录组
该数据集来自 NCBI，包含脓毒症患者全血细胞的转录组测序数据，并设有健康对照组。数据覆盖不同基础疾病的脓毒症患者，可用于分析脓毒症发生发展过程中基因表达变化及潜在调控机制，支持基于表达谱的分类或比较研究（来源 NCBI）
基本信息
资源简介
脓毒症患者全血细胞转录组
GSE294985 数据集收录了脓毒症患者全血细胞的转录组测序数据，并设有健康对照组用于比较分析。该数据集来自 NCBI，聚焦于脓毒症这一严重全身性感染所引发的全血细胞基因表达特征，纳入对象涵盖具有不同基础疾病的脓毒症患者。通过对全血细胞转录组的测序分析，该数据集可用于揭示脓毒症发生与进展过程中基因表达的关键变化及其潜在调控机制，支持基于表达谱的分类或比较研究。数据集以单个压缩文件形式提供，便于研究者下载后接入本地分析流程。
【数据集背景】
脓毒症是一种严重的全身性感染，常导致多器官功能障碍，其发病机制复杂，涉及多种细胞与分子通路的异常激活。该数据集正是围绕脓毒症患者全血细胞的转录组特征而建立，旨在通过测序手段分析全血细胞在脓毒症状态下的基因表达谱，进而揭示疾病发生和进展过程中的关键表达变化与潜在调控机制。研究在设计上纳入了具有不同基础疾病的脓毒症患者，并设置了健康对照组，以便开展组间比较分析。
【数据内容】
该数据集的主题标签包括“Expression profiling by high throughput sequencing”、GPL29480 与 9606，表明其数据属于高通量测序表达谱类型，物种为人。数据集共包含 1 个文件，文件样例为 GSE294985_series_matrix.txt.gz，即以 GZIP 压缩格式提供的系列矩阵文件。该文件承载了脓毒症患者全血细胞转录组的表达信息，并可与健康对照组数据进行对比。数据覆盖不同基础疾病的脓毒症患者，为分析基因表达变化及潜在调控机制提供了基础材料。
【采集与来源】
数据集来源于 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），源站标题为“Transcriptomes of human whole blood cells in sepsis patients”。作者为 Haiyan，Xue，发布时间为 Apr 17 202。数据采集对象为脓毒症患者及健康对照者的全血细胞，通过测序方式获取转录组表达谱。源站描述指出，研究通过测序分析脓毒症患者全血细胞的转录组，以揭示脓毒症发生和进展过程中基因表达的关键变化及其潜在调控机制。
【适用场景】
该数据集可用于分析脓毒症发生发展过程中基因表达的变化及潜在调控机制，支持基于表达谱的分类或比较研究。由于数据同时包含不同基础疾病的脓毒症患者与健康对照组，适合开展患者与健康个体之间、以及不同基础疾病背景患者之间的表达谱比较。此外，该数据也可用于探索全血细胞转录组在脓毒症相关研究中的应用价值。
【使用方法】
使用时可先下载数据文件 GSE294985_series_matrix.txt.gz，按文件格式以 GZIP 压缩包方式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入后续分析流程。由于数据集仅提供一个系列矩阵文件，使用时应以该文件为核心数据源，结合研究目的开展表达谱分析与比较。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量、样本量、测序深度或批次效应等方面的具体说明。数据集仅包含 1 个文件，未提供其他辅助文件或原始测序数据的说明。发布时间字段为“Apr 17 202”，年份信息不完整。使用者在分析前应自行核对数据字段与编码，并结合研究设计评估数据的适用性。
【引用与许可】
源站未提供引用方式与许可信息。使用该数据集时，建议参照 NCBI 来源站的相关要求进行引用与使用。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE294985
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本研究聚焦于脓毒症患者全血细胞的转录组特征。脓毒症是一种严重的全身性感染，常导致多器官功能障碍。其发病机制复杂，涉及多种细胞和分子通路的异常激活。通过测序分析脓毒症患者全血细胞的转录组，我们旨在揭示脓毒症发生和进展过程中基因表达的关键变化及其潜在调控机制。研究纳入了具有不同基础疾病的脓毒症患者，并设置了健康对照组进行比较分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
