重症疟疾研究转录组数据

资源简介

重症疟疾研究转录组数据

GSE289197 是一个来自 NCBI 的转录组数据集，标题为“Transcript data from a severe malaria study”，收录于血液及造血器官疾病 / 其他分类下。该数据集聚焦马里地区重症疟疾与无并发症疟疾之间的人体转录差异，重症病例涵盖脑型疟疾、重症疟疾贫血以及两者并发的情形。数据集共包含 1 个文件，样例文件为 GSE289197_series_matrix.txt.gz，采用高通量测序进行表达谱分析，物种为人（9606），平台标注为 GPL20301。作者为 Mark 与 Travassos，发布时间为 Feb 10 202。整体而言，该数据集为研究重症疟疾相关宿主转录特征提供了可下载的表达谱矩阵资源。

【数据集背景】

疟疾尤其是重症疟疾的宿主反应研究需要转录层面的数据支持。该数据集源自一项针对马里地区人群的疟疾研究，旨在刻画重症疟疾患者与无并发症疟疾对照之间的人体转录情况。源站描述指出，重症疟疾病例被划分为脑型疟疾、重症疟疾贫血，以及脑型疟疾与重症疟疾贫血并发三类，这为区分不同重症表现下的转录特征提供了样本层面的分组依据。

【数据内容】

数据集的核心内容是人类转录数据，主题标签为“Expression profiling by high throughput sequencing”，即基于高通量测序的表达谱分析。数据集仅包含 1 个文件，样例文件名为 GSE289197_series_matrix.txt.gz，属于系列矩阵文件，通常用于汇总样本层面的表达信息。物种标注为 9606，即人类；平台标注为 GPL20301。源站未提供具体的样本数量、基因数量或测序读长等信息。

【采集与来源】

数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI 平台收录的数据集。源站描述说明该数据来自马里的一项重症疟疾研究，涉及重症疟疾患者与无并发症疟疾对照的人体转录数据。作者为 Mark 与 Travassos，发布时间为 Feb 10 202。除上述信息外，源站未提供具体的采集地点细节、采样时间跨度、伦理审批信息或测序机构等信息。

【适用场景】

该数据集适用于比较重症疟疾与无并发症疟疾之间的人体转录差异，也适用于在重症疟疾内部区分脑型疟疾、重症疟疾贫血及两者并发等不同表现形式的转录特征研究。由于采用高通量测序表达谱，可用于差异表达分析、样本分组比较等通用转录组研究用途。具体分析目标需结合源站描述与数据本身确定，源站未提供预设的分析结论或验证结果。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE289197_series_matrix.txt.gz，按文件格式以 GZIP 压缩包方式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入，以避免因编码或字段解析问题导致批量处理出错。源站未提供额外的预处理步骤、标准化方法或分析流程说明。

【质量与限制】

数据集仅包含 1 个文件，且为系列矩阵形式，源站未提供原始测序数据、样本元数据明细或质控指标。源站未提供批次信息、缺失值情况或数据完整性说明。使用时应注意该数据集仅覆盖马里地区研究人群，源站未提供其他人群的适用性信息。发布时间标注为 Feb 10 202，年份信息不完整，源站未提供更精确的日期说明。

【引用与许可】

作者为 Mark 与 Travassos，数据来源于 NCBI。源站未提供具体的引用格式、发表文献信息或许可条款，使用前应向源站核实引用要求与使用许可。