恶性疟原虫ApiAP2转录因子PfAP2-V在红内期发育周期中调控寄生虫增殖与毒力的数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE288146

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疟疾的发病机制，包括寄生虫入侵、逸出和抗原变异，依赖于众多蛋白质的协同活动，然而其分子调控机制仍知之甚少。在此，我们明确了PfAP2-V——恶性疟原虫中一个关键的AP2转录因子——在红内期发育周期中的作用。PfAP2-V显示出两个不同的表达峰值，并且对寄生虫增殖、入侵以及毒力相关基因的调控至关重要。PfAP2-V的可诱导敲低通过阻断滋养体发育降低了寄生虫血症，这与毒力相关蛋白磷酸化水平的下调相关。此外，PfAP2-V敲低减少了PfEMP1的表达，损害了感染红细胞与内皮受体的粘附。全基因组染色体构象捕获和染色质免疫沉淀测序分析揭示，PfAP2-V敲低改变了染色质相互作用和可及性，破坏了抗原变异基因的调控。这些发现确立了PfAP2-V作为红内期不同阶段关键转录调控因子的地位。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。