再生改变红系前体细胞开放染色质与顺式调控景观

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE275430

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

应激性红细胞生成会提高红细胞（RBC）的生成速率，作为对贫血或缺氧等应激源的生理反应。为识别驱动贫血特异性基因表达和细胞反应的顺式调控变化，我们分析了在贫血诱导后多个时间点从小鼠中分离的红细胞前体富集细胞群体的染色质可及性。在贫血缓解超过1个月后，ATAC-seq数据中红细胞性状相关位点的代表性仍持续升高。总之，这些发现为理解红细胞祖细胞和前体细胞中再生依赖性转录组的早期建立和晚期缓解提供了框架。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。