儿童镰状细胞病体液免疫表型改变数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE262659

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

镰状细胞病（SCD）是一种与溶血和炎症相关的红细胞疾病，影响造血系统的稳态。虽然固有免疫和T细胞驱动的适应性免疫应答均参与驱动SCD相关炎症，但B细胞区室在SCD病理生理中的作用，尤其是在儿科患者中，仍知之甚少。为确定免疫变化的范围，我们通过流式细胞术评估了13种免疫细胞群体的频率，并检测了接受羟基脲治疗的儿科（n=13）和成人（n=12）SCD患者外周血（PB）中B细胞相关细胞因子的水平，并与种族匹配的儿科（n=5）和成人（n=10）对照进行比较。我们还评估了儿科SCD患者和对照组PB的bulk RNA测序。大多数SCD患者携带血红蛋白SS基因型（儿科92.3%，成人66.7%）。儿科SCD（PSCD）和成人SCD（ASCD）的平均羟基脲剂量分别为23.4 mg/kg和20.0 mg/kg。

实验室数据显示，PSCD组平均血红蛋白为9.4 g/dl，ASCD组为9.7 g/dl，儿童和成人SCD均存在溶血升高，PSCD组平均网织红细胞计数为7.1%，ASCD组为8.8%，儿童SCD平均绝对网织红细胞计数（ARC）为203 ± 94，成人SCD为214 ± 169。流式细胞术数据显示，儿童SCD与儿童对照相比，CD3+CD4+细胞增加1.9倍（p值0.012）；成人SCD与成人对照相比未见此变化（下降17%，p值0.302）。儿童SCD患者CD19+ B细胞增加3.5倍（p=0.005），但分化B细胞未见进一步增加，成人SCD与成人对照相比未见此变化（增加7%，p值0.815）。我们对儿童SCD患者与儿童对照的外周血（PB）进行了bulk RNA测序。获得的转录组数据表明，与体液免疫相关的转录本发生了显著变化。过表征分析（ORA）

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。