Wiskott-Aldrich综合征小鼠模型脾脏免疫细胞单细胞图谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE224259

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数据说明

Wiskott-Aldrich综合征（WAS）是一种以罕见的X连锁遗传性免疫缺陷为特征的疾病，由was基因突变引起，该基因在造血细胞中特异性表达，而脾脏在造血和红细胞清除中发挥重要作用。然而，迄今为止，尚未对野生型（WT）与WASp缺陷（WAS-KO）小鼠的脾脏进行全面的分析，尤其是在转录组水平上。本研究采用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术鉴定各类免疫细胞并探究免疫缺陷的机制。我们在11,269个细胞中鉴定出30个细胞簇和10种主要细胞亚型，包括B细胞、T细胞、树突状细胞（DC）、自然杀伤（NK）细胞、单核细胞、巨噬细胞、粒细胞、干细胞和红细胞。同时，我们评估了各细胞亚型的基因表达差异，并通过差异基因表达（DEGs）分析和富集分析揭示了WAS中这些不同细胞群体功能障碍的原因。

此外，通过比较特异性和非特异性免疫过程中各细胞类型的DEGs，筛选出了一些关键基因，进一步分析表明这些关键基因是WAS-KO小鼠中新发现的病理相关基因。总之，我们呈现了WAS-KO小鼠脾脏免疫细胞的详细单细胞分辨率图谱。这些前所未有的数据揭示了特异性和非特异性免疫细胞的转录特征，并鉴定了关键基因，为未来WAS研究奠定了基础，特别是在发现新的和尚未充分探索的机制以改进WAS基因治疗方面。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。