精神疾病患者与健康对照外周血全基因组DNA甲基化分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE222468

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们使用五种表观遗传时钟（Horvath、Hannum、PhenoAge、GrimAge和DunedinPoAm）评估了生物学衰老，这些时钟基于在外周血细胞中测量的DNA甲基化计算得出，样本来自一项跨诊断的精神病学研究，其中包括健康对照。我们发现，以加权评分表示的精神疾病负担与通过GrimAge和DunedinPoAm测量的生物学年龄加速显著相关。在童年期遭受身体虐待的个体中，衰老速度进一步加快。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。