Polycomb Group蛋白介导胎儿血红蛋白抑制的分子解析 [RNA-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE218232

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

胎儿血红蛋白（HbF）向成人血红蛋白（HbA）的转换是发育基因表达调控的典范，与镰状细胞病和β-地中海贫血相关。多梳抑制复合物（PRC）蛋白调控这一转换，PRC2的EED亚基抑制剂已进入激活胎儿血红蛋白的临床试验。然而，PcG复合物在此过程中的作用机制、其靶基因及相关亚基组成尚不清楚。在此，我们鉴定出PRC1亚基BMI1是一种新型HbF抑制因子。我们发现LIN28B、IGF2BP1和IGF2BP3是BMI1的直接靶标，并证明它们介导了BMI1的效应。通过对BMI1蛋白伴侣的物理和功能解析，揭示BMI1作为经典PRC1（cPRC1）亚复合物的一部分发挥作用。最后，我们证明BMI1/cPRC1与PRC2协同作用，通过相同的靶基因抑制HbF。我们的研究阐明了PRC如何沉默HbF，揭示了一种参与血红蛋白转换的表观遗传机制。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。