GSE199879:红细胞铁回收受损是衰老的早期标志
研究采用 10-11 月龄雌性小鼠,与年轻对照相比,其血清铁缺乏且脾脏出现铁过载,并伴随 RPMs 铁蓄积、氧化应激、溶酶体活性下降和红细胞吞噬率降低

基本信息
资源简介
GSE199879:红细胞铁回收受损是衰老的早期标志
Impaired iron recycling from erythrocytes is an early hallmark of aging
该数据集来自 NCBI GEO,标题为“Impaired iron recycling from erythrocytes is an early hallmark of aging”,聚焦衰老对红髓巨噬细胞(RPMs)功能及机体铁代谢的影响。研究采用 10-11 月龄雌性小鼠,与年轻对照相比,其血清铁缺乏且脾脏出现铁过载,并伴随 RPMs 铁蓄积、氧化应激、溶酶体活性下降和红细胞吞噬率降低。数据包含 1 个文件 GSE199879_series_matrix.txt.gz,属于高通量测序表达谱,可用于分析衰老相关铁稳态与红细胞参数变化的分子特征(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Mar 31 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):衰老影响铁稳态和红系造血,啮齿动物组织铁蓄积和老年人常见贫血即为证据。鉴于红髓巨噬细胞(RPMs)持续处理铁,其细胞功能可能易受年龄依赖性衰退的影响,从而影响机体铁代谢和红细胞(RBCs)参数。然而,关于衰老对 RPMs 功能的影响知之甚少。为研究衰老 RPMs,我们使用了 10-11 月龄雌性小鼠,与年轻对照相比,这些小鼠表现出铁缺乏和主要在脾脏中的铁过载。我们观察到这与 RPMs 中的铁蓄积、氧化应激、溶酶体活性降低和红细胞吞噬率下降有关。我们发现,RPMs 的这些损伤导致衰老红细胞在脾脏中滞留、其过度局部溶血以及铁和
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL19057、10090。本站分类:血液及造血器官疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE199879
【使用注意】
· 源站最后修改于 May 07 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
衰老会影响铁稳态和红细胞生成,这一点在啮齿动物中的组织铁蓄积以及老年人中常见的贫血中得到了证实。鉴于红髓巨噬细胞(RPMs)持续处理铁,其细胞功能可能易受年龄依赖性衰退的影响,从而影响机体铁代谢和红细胞(RBCs)参数。然而,关于衰老对RPMs功能的影响知之甚少。为了研究衰老的RPMs,我们采用了10-11个月大的雌性小鼠,与年轻对照组相比,这些小鼠表现出血清铁缺乏和主要在脾脏中的铁过载。我们观察到这与RPMs中的铁蓄积、氧化应激、溶酶体活性降低以及红细胞吞噬率下降有关。我们发现,RPMs的这些损伤导致衰老红细胞在脾脏中滞留、其过度局部溶血,以及形成富含铁和血红素的大型细胞外蛋白聚集体,这些聚集体很可能来源于受损的铁死亡RPMs。
我们进一步发现,给小鼠喂食低铁饮食可减轻RPMs中的铁积累和活性氧积聚,改善其清除和降解红细胞的能力,并限制铁死亡。因此,这种饮食改善了衰老小鼠脾脏红细胞的适应性,限制了溶血和富铁蛋白聚集体的形成,并提高了血清铁的可用性。利用类RPM细胞,我们表明RPMs吞噬红细胞和溶酶体活性的降低可归因于铁水平升高和血红素分解代谢酶血红素加氧酶1(HO-1)表达降低的共同作用。综上所述,我们确定RPM功能障碍是生理性衰老的早期标志,并证明饮食中铁的减少可改善铁周转效率。该数据集是在国家科学中心Sonata Bis资助(UMO-2020/38/E/NZ4/00511)的支持下获得的。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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