GSE199879:红细胞铁回收受损是衰老的早期标志

研究采用 10-11 月龄雌性小鼠,与年轻对照相比,其血清铁缺乏且脾脏出现铁过载,并伴随 RPMs 铁蓄积、氧化应激、溶酶体活性下降和红细胞吞噬率降低

geo
浏览 17
基因组分类GPL1905710090
GSE199879: Impaired iron recycling from erythrocytes is an early hallmark of aging

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

GSE199879:红细胞铁回收受损是衰老的早期标志

Impaired iron recycling from erythrocytes is an early hallmark of aging

该数据集来自 NCBI GEO,标题为“Impaired iron recycling from erythrocytes is an early hallmark of aging”,聚焦衰老对红髓巨噬细胞(RPMs)功能及机体铁代谢的影响。研究采用 10-11 月龄雌性小鼠,与年轻对照相比,其血清铁缺乏且脾脏出现铁过载,并伴随 RPMs 铁蓄积、氧化应激、溶酶体活性下降和红细胞吞噬率降低。数据包含 1 个文件 GSE199879_series_matrix.txt.gz,属于高通量测序表达谱,可用于分析衰老相关铁稳态与红细胞参数变化的分子特征(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Mar 31 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):衰老影响铁稳态和红系造血,啮齿动物组织铁蓄积和老年人常见贫血即为证据。鉴于红髓巨噬细胞(RPMs)持续处理铁,其细胞功能可能易受年龄依赖性衰退的影响,从而影响机体铁代谢和红细胞(RBCs)参数。然而,关于衰老对 RPMs 功能的影响知之甚少。为研究衰老 RPMs,我们使用了 10-11 月龄雌性小鼠,与年轻对照相比,这些小鼠表现出铁缺乏和主要在脾脏中的铁过载。我们观察到这与 RPMs 中的铁蓄积、氧化应激、溶酶体活性降低和红细胞吞噬率下降有关。我们发现,RPMs 的这些损伤导致衰老红细胞在脾脏中滞留、其过度局部溶血以及铁和

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL19057、10090。本站分类:血液及造血器官疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE199879

【使用注意】

· 源站最后修改于 May 07 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE199879

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

衰老会影响铁稳态和红细胞生成,这一点在啮齿动物中的组织铁蓄积以及老年人中常见的贫血中得到了证实。鉴于红髓巨噬细胞(RPMs)持续处理铁,其细胞功能可能易受年龄依赖性衰退的影响,从而影响机体铁代谢和红细胞(RBCs)参数。然而,关于衰老对RPMs功能的影响知之甚少。为了研究衰老的RPMs,我们采用了10-11个月大的雌性小鼠,与年轻对照组相比,这些小鼠表现出血清铁缺乏和主要在脾脏中的铁过载。我们观察到这与RPMs中的铁蓄积、氧化应激、溶酶体活性降低以及红细胞吞噬率下降有关。我们发现,RPMs的这些损伤导致衰老红细胞在脾脏中滞留、其过度局部溶血,以及形成富含铁和血红素的大型细胞外蛋白聚集体,这些聚集体很可能来源于受损的铁死亡RPMs。

我们进一步发现,给小鼠喂食低铁饮食可减轻RPMs中的铁积累和活性氧积聚,改善其清除和降解红细胞的能力,并限制铁死亡。因此,这种饮食改善了衰老小鼠脾脏红细胞的适应性,限制了溶血和富铁蛋白聚集体的形成,并提高了血清铁的可用性。利用类RPM细胞,我们表明RPMs吞噬红细胞和溶酶体活性的降低可归因于铁水平升高和血红素分解代谢酶血红素加氧酶1(HO-1)表达降低的共同作用。综上所述,我们确定RPM功能障碍是生理性衰老的早期标志,并证明饮食中铁的减少可改善铁周转效率。该数据集是在国家科学中心Sonata Bis资助(UMO-2020/38/E/NZ4/00511)的支持下获得的。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案