NFI因子抑制成人红系细胞胎儿血红蛋白[RNA-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE180869

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

胎儿型β-珠蛋白样基因HBG1和HBG2在成人红系前体细胞中被沉默的机制，是人类发育中的一个基础生物学问题。逆转这一机制对β-血红蛋白病（如镰状细胞病，SCD）有益。一项CRISPR-Cas9遗传筛选发现了NFI转录因子家族的两个成员——NFIA和NFIX——作为新型HBG1/2阻遏物。这两种因子在成人红系细胞中表达水平升高，其单独或联合缺失在培养细胞和人-鼠异种移植实验中揭示了HBG1/2调控中的协同作用，以及在防止SCD来源的成红细胞镰状化方面的协同作用。基因组分析、基因编辑和体外结合实验表明，NFIA和NFIX因子的强效协同活性部分可通过其激活BCL11A表达的能力来解释（BCL11A是HBG1/2基因的已知沉默因子），部分则通过两个直接结合位点抑制HBG1/2基因来解释。NFI因子成为β-珠蛋白产生中胎儿至成人转换的多功能调控因子。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。