GSE149894:疟疾感染一次的小鼠脾脏红髓巨噬细胞与未感染小鼠产前播种的红髓巨噬细胞转录组相同

该数据集来自 NCBI GEO,包含 GSE149894 系列矩阵文件,采用 Affymetrix Mouse Exon 1.0 ST 芯片对 C57Bl/6J 小鼠脾脏红髓巨噬细胞进行表达谱分析

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基因组分类Expression profiling by arrayGPL2025810090
GSE149894: Tissue printing: splenic red pulp macrophages of once-malaria infected mice are transcriptionally identical to prenatally seeded red pulp macrophages from uninfected mice.

基本信息

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基因组
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创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

GSE149894:疟疾感染一次的小鼠脾脏红髓巨噬细胞与未感染小鼠产前播种的红髓巨噬细胞转录组相同

Tissue printing: splenic red pulp macrophages of once-malaria infected mice are transcriptionally identical to prenatally seeded red pulp macrophages from uninfected mice.

该数据集来自 NCBI GEO,包含 GSE149894 系列矩阵文件,采用 Affymetrix Mouse Exon 1.0 ST 芯片对 C57Bl/6J 小鼠脾脏红髓巨噬细胞进行表达谱分析。样本覆盖急性疟疾感染(P. chabaudi AS 轻症或 AJ 重症)后清除寄生虫的小鼠与未感染年龄匹配小鼠,比较感染后恢复的红髓巨噬细胞与胚胎期播种的红髓巨噬细胞的转录组。数据可用于研究疟疾感染对组织驻留巨噬细胞的长期影响及转录组相似性分析(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:May 05 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):急性疟疾感染(P. chabaudi)会清除 C57Bl/6J 小鼠脾脏中胚胎期播种的组织驻留红髓巨噬细胞——无论感染是轻症(蚊媒传播的 P. chabaudi AS——无高寄生虫血症,除轻度贫血外无可测量的疾病临床表现)还是重症(蚊媒传播的 P. chabaudi AJ——急性高寄生虫血症、严重贫血、低体温和虚脱)。红髓巨噬细胞在 100 天后、小鼠清除寄生虫血症后恢复。随后我们通过流式分选将 10,000 个红髓巨噬细胞(lineage-, autofluorescent, F4/80+, B220-, CD11bint, CD11cint)直接分选到 Trizol 中,提取总 RNA 并使用 affymetrix mouse exon 1.0 ST array 分析其转录组。将曾感染轻症 AS 或重症 AJ P. chabaudi 寄生虫的小鼠的红髓巨噬细胞与未感染的年龄匹配小鼠进行比较。我们 unc

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL20258、10090。本站分类:血液及造血器官疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE149894

【使用注意】

· 源站最后修改于 Mar 29 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
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数据说明

急性疟疾感染(无论是由蚊子传播的P. chabaudi AS株——无高寄生虫血症,除轻度贫血外无可测量的疾病临床表现,还是由蚊子传播的P. chabaudi AJ株——急性高寄生虫血症、严重贫血、低体温和虚脱)均会消除C57Bl/6J小鼠脾脏中胚胎期播种的组织驻留红髓巨噬细胞。在小鼠清除寄生虫血症100天后,红髓巨噬细胞重新出现。随后,我们通过流式分选将10,000个红髓巨噬细胞(谱系阴性、自发荧光、F4/80+、B220-、CD11b中等表达、CD11c中等表达)直接分选入Trizol中,提取总RNA并使用Affymetrix小鼠外显子1.0 ST芯片分析其转录组。将曾感染轻度AS或重度AJ P. chabaudi寄生虫的小鼠的红髓巨噬细胞与未感染的年龄匹配小鼠进行比较。我们发现,从曾感染疟疾的小鼠脾脏中分离的红髓巨噬细胞在转录水平上与未感染小鼠产前播种的红髓巨噬细胞完全相同。因此,无论这些细胞的来源如何,脾脏组织微环境都会在其上印记相同的功能特征。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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