再生障碍性贫血与健康供者HSPCs和T细胞的转录组分析

该数据集为GSE145669超级系列,标题为再生障碍性贫血(AA)与健康供者HSPCs和T细胞的转录组分析,来源为NCBI

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基因组分类GPL203019606
GSE145669: Transcriptome analysis of HSPCs and T cells from aplastic anemia (AA) and healthy donors

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

再生障碍性贫血与健康供者HSPCs和T细胞的转录组分析

GSE145669 是一个聚焦于再生障碍性贫血(AA)与健康供者造血干/祖细胞(HSPCs)及 T 细胞的转录组分析数据集,标题为“Transcriptome analysis of HSPCs and T cells from aplastic anemia (AA) and healthy donors”,来源为 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov)。该数据集在本站归入“血液及造血器官疾病 / 其他”分类,以超级系列(SuperSeries)形式组织,由若干子系列构成。数据集包含 1 个文件,样例文件名为 GSE145669_series_matrix.txt.gz,采用高通量测序进行表达谱分析,物种为人(9606),平台编号为 GPL20301。作者为 Caiying Zhu,发布时间为 Feb 21 202。整体上,该数据集面向血液疾病转录组研究,可用于了解 AA 患者与健康供者在 HSPCs 和 T 细胞层面的基因表达特征。

【数据集背景】

再生障碍性贫血是一种以骨髓造血功能衰竭为特征的血液疾病,涉及造血干/祖细胞数量或功能异常以及免疫介导的骨髓损伤。该数据集以“再生障碍性贫血(AA)与健康供者 HSPCs 和 T 细胞的转录组分析”为主题,旨在通过高通量测序表达谱数据,对 AA 患者与健康供者的两类关键细胞群体进行比较性转录组研究。数据集以 SuperSeries 形式发布,源站描述指出该超级系列由下列子系列组成,说明其内容按子系列组织,便于按细胞类型或分析目的分别获取。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件,样例文件为 GSE145669_series_matrix.txt.gz,属于 GZIP 压缩格式的系列矩阵文件,通常用于汇总样本层面的表达信息。主题标签显示其数据类型为“Expression profiling by high throughput sequencing”,即基于高通量测序的表达谱分析;物种标签为 9606(人);平台标签为 GPL20301。数据集标题明确覆盖 HSPCs 与 T 细胞两类细胞,并同时包含再生障碍性贫血患者与健康供者样本。关于样本数量、分组细节、具体基因数量及表达矩阵的具体字段构成,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov),源站标题与数据集英文名一致。作者为 Caiying Zhu,发布时间为 Feb 21 202。数据集在本站被归入“血液及造血器官疾病 / 其他”分类。源站描述仅说明该 SuperSeries 由下列子系列组成,未提供更详细的采样地点、伦理审批、样本处理流程或测序平台的具体仪器信息,这些内容源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于血液及造血器官疾病领域的转录组研究场景,尤其是围绕再生障碍性贫血的发病机制探索、患者与健康供者之间 HSPCs 和 T 细胞的表达谱比较,以及免疫相关与造血相关基因表达特征的分析。由于数据基于高通量测序表达谱,可用于差异表达分析、样本聚类与分型探索等通用转录组分析用途。具体到该数据集是否适合某一特定分析目标,需结合样本设计与元数据判断;源站未提供完整的样本设计说明。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE145669_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以避免因编码或字段理解偏差导致后续分析错误。由于该数据集为 SuperSeries,实际分析时还需结合其子系列信息理解数据组织方式;子系列的具体构成与内容,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集以 SuperSeries 形式发布,源站描述仅说明其由子系列组成,未提供质控指标、测序深度、批次信息或数据完整性说明,相关质量信息源站未提供。数据集仅含 1 个文件,文件层面的样本覆盖范围与字段含义需在使用前核对。此外,发布时间写作“Feb 21 202”,年份信息不完整,源站未提供更明确的日期说明。使用时应以实际下载文件内容为准,避免对未提供的样本量、分组比例或统计结果作出推断。

【引用与许可】

该数据集的作者为 Caiying Zhu,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于引用格式、许可条款与使用限制,源站未提供,使用前应查阅源站页面获取相应说明。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE145669

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

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