核糖体生物发生过程中p53激活调控正常红细胞分化 [表达谱]

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE137951

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数据说明

核糖体生物合成在红系发育中的作用得到了对Diamond-Blackfan贫血和5q-综合征中核糖体病红系缺陷的认可的支持。核糖体生物合成是否对正常红系发育具有调节功能仍不清楚。在本研究中，对人类和小鼠红系生成过程中核糖体生物合成动态的详细表征显示，核糖体生物合成因rDNA转录下降和核糖体蛋白新合成崩溃而突然中断。通过RNA聚合酶I抑制剂CX-5461使其过早停滞，靶向未成熟红系母细胞的增殖。我们还显示，p53自发激活或响应CX-5461与核糖体生物合成停滞同时发生，并驱动一个转录程序，其中涉及细胞周期停滞、凋亡负调控和DNA损伤响应的基因被上调。RNA聚合酶I转录应激导致核仁破坏和ATR-CHK1-p53通路的激活。我们的结果意味着核糖体生物合成消失和p53激活的时机对红系发育至关重要。

在核糖体病中，核糖体可用性因核糖体蛋白生成不平衡而改变，核糖体生物合成下调的阈值可能过早达到，并与病理性的p53激活共同阻止了红系祖细胞的正常扩增。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。