GSE120169:早期发育窗口研究揭示小鼠与人类范可尼贫血中严重的HSC缺陷

该数据集来自NCBI,标题为早期发育窗口研究揭示小鼠与人类范可尼贫血中严重的HSC缺陷,属于血液及造血器官疾病分类。该SuperSeries由若干SubSeries组成,可用于研究范可尼贫血在早期发育阶段的造血干细胞缺陷及基因表达特征(来源 NCBI)

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基因组分类Expression profiling by arrayGPL235359606
GSE120169: Studies in an early development window unveils a severe HSC defect in both murine and human Fanconi anemia

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

GSE120169:早期发育窗口研究揭示小鼠与人类范可尼贫血中严重的HSC缺陷

GSE120169 是一项来自 NCBI 的基因表达谱数据集,标题为“Studies in an early development window unveils a severe HSC defect in both murine and human Fanconi anemia”,即通过早期发育窗口的研究,揭示小鼠与人类范可尼贫血中严重的造血干细胞缺陷。该数据集归属于血液及造血器官疾病 / 其他分类,以 SuperSeries 形式组织,由若干 SubSeries 组成,主题涉及芯片表达谱分析,物种信息标注为人类(9606),平台编号为 GPL23535。数据集作者为 Franck、Letourneur,发布时间为 2019 年 9 月 19 日,共包含 1 个文件,样例文件为 GSE120169_series_matrix.txt.gz。整体而言,该数据集面向范可尼贫血早期发育阶段造血干细胞缺陷及基因表达特征的研究。

【数据集背景】

范可尼贫血是一种涉及造血系统异常的疾病,其造血干细胞缺陷的机制是相关研究关注的重点。该数据集以“早期发育窗口”为研究切入点,旨在同时考察小鼠与人类范可尼贫血中严重的造血干细胞缺陷。源站标题明确表达了这一研究主题,数据集因此被归入血液及造血器官疾病 / 其他分类,适合用于探索该疾病在早期发育阶段的表达层面特征。

【数据内容】

该数据集为 SuperSeries,源站描述指出其由下列 SubSeries 组成。主题标签显示其属于“Expression profiling by array”,即基于芯片的表达谱分析,涉及平台 GPL23535,物种标注为 9606。数据集文件数量为 1,文件样例为 GSE120169_series_matrix.txt.gz,属于 GZIP 压缩格式的系列矩阵文件。该文件通常用于承载表达谱系列层面的样本与表达信息,具体字段构成需以实际文件为准。

【采集与来源】

数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,作者为 Franck、Letourneur,发布时间为 2019 年 9 月 19 日。源站描述仅说明该 SuperSeries 由若干 SubSeries 组成,未提供更详细的样本采集地点、采集时间、实验流程或受试者信息,相关内容源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于研究范可尼贫血在早期发育阶段的造血干细胞缺陷及基因表达特征,适合开展基于芯片表达谱的比较分析与表达模式考察。其 SuperSeries 结构也便于按 SubSeries 组织分析。由于涉及小鼠与人类两个层面的研究主题,可用于跨物种表达特征的对照性探索。具体分析设计应结合数据实际内容确定,源站未提供推荐的分析方案。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE120169_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以避免因字段解析或编码问题导致后续分析偏差。对于 SuperSeries 结构,可结合其 SubSeries 分别组织数据。源站未提供更详细的使用步骤或代码示例。

【质量与限制】

该数据集文件数量为 1,源站描述较为简略,仅说明 SuperSeries 的组成关系,未提供样本量、数据完整性、质控指标或批次信息,相关内容源站未提供。使用时应注意 SuperSeries 与 SubSeries 之间的层级关系,并以实际文件内容核对字段与编码。由于缺乏源站提供的质控与限制说明,无法进一步评估其数据质量细节。

【引用与许可】

数据集作者为 Franck、Letourneur,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。源站未提供具体的许可条款或引用格式要求,相关内容源站未提供。使用或引用时应以源站页面信息为准。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE120169

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

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