免疫功能低下患者组织与胸腔积液样本中Aspergillus PCR性能评估

该数据集来自clinicaltrials.gov,关注免疫功能低下患者中侵袭性曲霉病的诊断问题。由于传统培养方法敏感性低,尤其在抗真菌预防或快速治疗背景下,研究转向在组织与胸腔积液等临床标本中直接使用Aspergillus特异性PCR进行检测

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clinicaltrials
浏览 14
其他分类AspergillosisImmunosuppression
Evaluation of Performance of An Aspergillus PCR in Tissue and Pleural Effusion Samples of Immunocompromised Patients

基本信息

模态
其他
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

免疫功能低下患者组织与胸腔积液样本中Aspergillus PCR性能评估

该数据集围绕免疫功能低下患者中侵袭性曲霉病的诊断难题展开,来源于clinicaltrials.gov,英文名称为“Evaluation of Performance of An Aspergillus PCR in Tissue and Pleural Effusion Samples of Immunocompromised Patients”。其关注的核心问题是:在血液系统恶性肿瘤患者中,侵袭性曲霉病虽然常见且致命,但诊断仍然困难,原因在于传统培养方法敏感性较低,尤其是在当前普遍采用抗真菌预防或快速抗真菌治疗的临床实践中更为明显。因此,研究转向在组织与胸腔积液等临床标本中直接使用Aspergillus特异性聚合酶链反应(PCR)进行检测,以评估其性能,并可能帮助明确致病病原体。该数据集所属分类为血液及造血器官疾病 / 其他,主题标签包括Aspergillosis和Immunosuppression。

【数据集背景】

该数据集所对应的研究背景是:侵袭性曲霉病是血液系统恶性肿瘤患者中常见且致命的并发症,但诊断始终是一个难题。基于培养的方法敏感性低,特别是在当前临床实践中广泛进行抗真菌预防或快速抗真菌治疗的情况下,培养阳性结果更为有限。在某些临床情境下,对潜在感染病原体进行活检鉴定变得重要。然而,由于培养方法仅在少数患者中能够获得结果,使用非培养方法,如Aspergillus特异性PCR,直接在临床标本中检测侵袭性曲霉病,正变得越来越重要,并可能有助于表征致病病原体。因此,该研究旨在评估一种已建立的Aspergillus特异性巢式PCR在活检、切除组织以及胸腔积液标本中的性能。

【数据内容】

该数据集来自clinicaltrials.gov,源站描述中提及的条件包括Aspergillosis和Immunosuppression。其英文名称明确指向在免疫功能低下患者的组织和胸腔积液样本中评估Aspergillus PCR的性能。主题标签为Aspergillosis和Immunosuppression。关于数据集具体包含多少样本、多少字段、何种变量结构、是否包含原始PCR结果或临床结局等详细内容,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为clinicaltrials.gov。源站描述中提及的研究对象为免疫功能低下患者,尤其是血液系统恶性肿瘤患者。研究涉及在组织与胸腔积液等临床标本中直接使用Aspergillus特异性PCR进行检测。关于具体的采集时间、采集地点、纳入排除标准、样本量、采集流程等详细信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于关注免疫功能低下患者中侵袭性曲霉病诊断的研究场景,特别是当传统培养方法敏感性低、抗真菌预防或快速抗真菌治疗普遍存在时,探索非培养方法如Aspergillus特异性PCR在组织和胸腔积液标本中的检测性能。其主题标签Aspergillosis和Immunosuppression也表明其适用于曲霉病和免疫抑制相关领域。关于该数据集是否可用于临床决策支持、流行病学监测或其他具体应用,源站未提供。

【使用方法】

关于该数据集的具体使用方法,例如如何访问、如何下载、是否需要申请、是否提供数据字典、是否支持直接分析等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集基于clinicaltrials.gov的来源信息,其源站描述中已指出培养方法敏感性低,尤其在抗真菌预防或快速抗真菌治疗背景下,且培养方法仅在少数患者中产生结果。这些因素可能构成该研究领域的固有挑战。关于该数据集本身的质量控制、数据完整性、偏倚风险、样本代表性、缺失值处理等具体限制,源站未提供。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款、是否允许再分发或商业使用等信息,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT01902030

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件:曲霉病、免疫抑制。尽管侵袭性曲霉病(IA)是血液系统恶性肿瘤患者常见且致命的并发症,但其诊断仍是一个难题,因为基于培养的方法敏感性较低,尤其是在当前抗真菌预防或快速抗真菌治疗的临床实践下。在某些临床情况下,进行活检以鉴定潜在的感染病原体变得十分重要。然而,由于基于培养的方法仅在少数患者中能获得结果,使用非培养方法如曲霉特异性聚合酶链反应(PCR)直接在临床标本中检测IA正变得越来越重要,并可能有助于确定致病病原体。因此,本研究评估了在活检组织、再切除标本或胸腔积液中应用已建立的曲霉特异性巢式PCR的效果。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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