EGAS00001006545 样本数据集
该数据集来源于 omicsdi.org，属于血液及造血器官疾病/其他分类，主题标签为 Genomics。样本围绕 DNA 链间交联（ICL）修复研究，涉及 Fanconi Anemia（FA）相关通路以及新发现的潜在调控因子 C1orf112 和 THAP12
基本信息
资源简介
EGAS00001006545 样本数据集
该数据集来源于 omicsdi.org，属于血液及造血器官疾病/其他分类，主题标签为 Genomics。样本围绕 DNA 链间交联（ICL）修复研究，涉及 Fanconi Anemia（FA）相关通路以及新发现的潜在调控因子 C1orf112 和 THAP12。数据可用于分析这些因子缺失后对 ICL 诱导剂如 Mitomycin C（MMC）的敏感性、微核水平升高及 S 期 DNA 损伤积累等表型，支持 DNA 损伤修复与基因组稳定性相关研究（来源 omicsdi.org）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：最危险的 DNA 损伤形式之一是链间交联（ICL），它共价交联 DNA 双螺旋的两条链。由于这些损伤能够阻断转录和 DNA 复制，其修复对细胞存活至关重要。最初，ICL 修复的主要通路涉及一个由 22 个基因组成的网络，这些基因在一种称为 Fanconi Anemia（FA）的严重人类遗传病中发生突变。利用近单倍体人 HAP1 细胞系中的合成致死筛选，我们最近鉴定了两个潜在的新型 ICL 修复调控因子：C1orf112 和 THAP12。C1orf112 和 THAP12 的缺失导致对诱导 ICL 的 DNA 损伤剂如 Mitomycin C（MMC）高度敏感。此外，C1orf112 耗竭的细胞显示微核水平升高以及 S 期 DNA 损伤积累。为了更好地理解 C1orf112 和 THAP12
【主题与分类】
主题标签：Genomics。本站分类：血液及造血器官疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001010298
下载信息
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源站：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001010298
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
最危险的DNA损伤形式之一是链间交联（ICLs），它通过共价键将DNA双螺旋的两条链连接起来。由于这些损伤能够阻碍转录和DNA复制，其修复对细胞存活至关重要。最初，描述的主要ICL修复途径涉及一个由22个基因组成的网络，这些基因在一种名为范可尼贫血（FA）的严重人类遗传病中发生突变。利用近单倍体人HAP1细胞系中的合成致死筛选，我们最近发现了两个潜在的新型ICL修复调节因子，C1orf112和THAP12。C1orf112和THAP12的缺失导致对诱导ICL的DNA损伤剂，如丝裂霉素C（MMC），高度敏感。此外，C1orf112耗竭的细胞显示出微核水平升高和S期DNA损伤积累。为了更好地理解C1orf112和THAP12如何介导ICL修复，我们希望使用BotSeq方法进行突变特征分析。因此，将野生型、C1orf112和THAP12敲除细胞在载体或MMC处理条件下培养10天，并分离基因组DNA。
在此实验设置中，FANCA和FANCD2敲除细胞作为对照一并采用。本数据集包含截至2023年4月20日该研究所有可用的数据。
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