尼泊尔高海拔藏族女性自然选择检测数据
该数据集来自尼泊尔约1000名世居高海拔的藏族女性,用于研究人类适应性演化中的选择压力、适应表型、有益等位基因与适合度差异

基本信息
资源简介
尼泊尔高海拔藏族女性自然选择检测数据
Data from: Detecting past and ongoing natural selection among ethnically Tibetan women at high altitude in Nepal
该数据集来自尼泊尔约1000名世居高海拔的藏族女性,用于研究人类适应性演化中的选择压力、适应表型、有益等位基因与适合度差异。数据涵盖全基因组关联分析及多基因适应检测,涉及妊娠次数、活产数、后代死亡率及血红蛋白水平等表型,并关联EPAS1单倍型的选择性清除信号。可用于探索高海拔适应、生殖适合度与自然选择机制(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可)。
【数据集背景】
源站首次发布:2019。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):人类适应性演化很少被完整刻画其全部组成,即选择压力、适应表型、有益等位基因和已实现的适合度差异。我们结合了检测选择性清除和多基因适应的方法,以及对生理和生育表型的遗传基础进行定位的方法,研究对象为约1000名来自尼泊尔、适应高海拔的世居藏族女性。我们进行了全基因组关联分析和多基因适应检验,结果显示,与更多妊娠和活产相关的等位基因存在正选择证据,而与更高后代死亡率相关的等位基因存在负选择证据。较低的血红蛋白水平未显示出明确的多基因适应证据,尽管其与携带选择性清除信号的EPAS1单倍型有强关联。
【主题与分类】
主题标签:Hypoxia、Homo Sapiens、High Altitude、Holocene。本站分类:血液及造血器官疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.bp46m
使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://doi.org/10.5061/dryad.bp46m
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 7.23 GB。
数据说明
人类适应性进化的全部组成部分,即选择压力、适应性表型、有益等位基因及实现的适合度差异,很少得到全面表征。我们综合了检测选择性清除和多基因适应的方法,以及映射生理和生育表型遗传基础的方法,研究对象为约1000名来自尼泊尔、适应高海拔的土著藏族女性。我们进行了全基因组关联分析和多基因适应测试,结果显示,与更多妊娠和活产相关的等位基因有正选择证据,而与较高后代死亡率相关的等位基因则有负选择证据。较低的血红蛋白水平并未显示出多基因适应的明确证据,尽管它与携带选择性清除信号的EPAS1单倍型有强关联。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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