造血主调控因子驱动的自噬

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-32491

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数据说明

细胞器的发育性和稳态性重塑由一种称为自噬的复杂过程介导。构成自噬机制的蛋白质群在多步骤生化途径中发挥作用。尽管自噬机制的组分广泛表达，但自噬可发生在特化的细胞环境中，而细胞类型特异性自噬的机制尚知之甚少。我们证明，造血作用的主调控因子GATA-1直接激活编码必需自噬组分微管相关蛋白1轻链3B（LC3B）及其同源物（MAP1LC3A、GABARAP、GABARAPL1、GATE-16）的基因转录。此外，GATA-1直接激活参与溶酶体生物发生/功能的基因，溶酶体介导自噬性蛋白质周转。我们证明，GATA-1利用叉头蛋白FoxO3激活部分自噬基因。GATA-1依赖性的LC3B诱导与活性形式LC3B及自噬体的积累紧密偶联，后者介导线粒体清除，这是红细胞生成中的关键步骤。

这些结果揭示了一种新机制，即发育主调控因子通过建立遗传网络来启动细胞类型特异性自噬。GATA1因子在原代人PBMC来源红系母细胞中的全基因组占据图谱

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。