本研究检测到的新型错义突变预测软件分析
数据可用于评估错义突变导致蛋白质损伤、结构稳定性下降及致病可能性的预测表现，服务于出血性疾病与凝血相关遗传变异的研究场景（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）
基本信息
资源简介
本研究检测到的新型错义突变预测软件分析
Prediction software analysis of novel missense mutations detected in the present study.
该数据集来自 figshare，包含一份 Table_5.xls 文件，汇集了针对本研究检测到的 novel missense mutations 使用多种预测软件得到的分析结果，涉及 Polyphen-2、SIFT、Align GVGD、MUpro 与 SVM 等工具的评分信息。数据可用于评估错义突变导致蛋白质损伤、结构稳定性下降及致病可能性的预测表现，服务于出血性疾病与凝血相关遗传变异的研究场景（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。
【数据集背景】
源站首次发布：2014-03-27。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：Polyphen-2 - 评分 0 到 1 表示蛋白质损伤概率从低到高的置信度。SIFT - 被视为致病的突变显示评分 Align GVGD - 评分越高，突变导致蛋白质损伤性质的概率越高 MUpro - SVM 评分中负值越大，蛋白质结构稳定性下降的概率越高。SVM - 支持向量机（SVM 评分 – 新型错义突变的负评分显示致病概率）。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 5.63 KB。数据集 DOI：10.1371/journal.pone.0092575.t005。
【主题与分类】
源站学科分类：Biological Sciences。主题标签：cell biology、Molecular cell biology、Evolutionary biology、population genetics、genetics、mutation、Diagnostic medicine、hematology、Blood coagulation、Coagulation disorders。本站分类：血液与淋巴系统疾病/出血性疾病。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biological Sciences。
【获取与许可】
源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Prediction_software_analysis_of_novel_missense_mutations_detected_in_the_present_study_/977131
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Kasatkar, Priyanka; Shetty, Shrimati; Ghosh, Kanjaksha (2015). Prediction software analysis of novel missense mutations detected in the present study.. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-01，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Figshare）
- 源站标题：Prediction software analysis of novel missense mutations detected in the present study.
- DOI：10.1371/journal.pone.0092575.t005
- 发布日期：2014-03-27
- 文件数：1 个
- 文件总体积：5.63 KB
- 源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Prediction_software_analysis_of_novel_missense_mutations_detected_in_the_present_study_/977131
命令行下载
curl -L -o "Table_5.xls" "https://ndownloader.figshare.com/files/1438674"
文件清单
Table_5.xls（5.63 KB）
文件总体积 5.63 KB（源站 API 实测）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据说明
PolyPhen-2——评分范围为0至1，表示蛋白质损伤可能性的置信度由低到高。
SIFT——突变被视为致病性，显示评分。Align GVGD——评分越高，突变导致蛋白质损伤性质的可能性越大。
MUpro——SVM评分中负值越大，蛋白质结构稳定性下降的可能性越高。
SVM——支持向量机（SVM评分——新型错义突变的负评分显示致病概率）。
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0092575.t005（source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Prediction_software_analysis_of_novel_missense_mutations_detected_in_the_present_study_/977131）。
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