最小数据集:中国人群 HLA 与血液病关联研究

该数据集来自 figshare,属于血液与淋巴系统疾病下的良性血液病分类,文件为一份 xlsx 表格。研究对 123913 份血液样本(43568 例患者与 80345 例无已知病理个体)进行 HLA I 类和 II 类测序分型,分析 HLA 与中国人群恶性及良性血液病之间的关联,识别出高频风险等位

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2024-04-09 更新
浏览 7
基因组分类received little attentionii using sequencinghuman leukocyte antigenmalignant hematologic diseasesbenign hematologic disordersfrequency risk allelesfrequency susceptible genotypeshla susceptibility allelesfrequency alleleshla alleleshematological disordershematological diseases
The minimal data set.

基本信息

模态
基因组
大小
0.012107378 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2024-04-09
版本
v1

资源简介

最小数据集:中国人群 HLA 与血液病关联研究

The minimal data set.

该数据集来自 figshare,属于血液与淋巴系统疾病下的良性血液病分类,文件为一份 xlsx 表格。研究对 123913 份血液样本(43568 例患者与 80345 例无已知病理个体)进行 HLA I 类和 II 类测序分型,分析 HLA 与中国人群恶性及良性血液病之间的关联,识别出高频风险等位基因与易感基因型。数据可用于 HLA 等位基因频率比较、血液病风险关联分析及相关分类建模(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2024-04-09。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):已鉴定出若干参与发病机制的基因,其中人类白细胞抗原(HLA)系统发挥关键作用。然而,HLA 与一组血液系统疾病之间的关系在中国鲜有关注。对来自 43568 例患者和 80345 例无已知病理个体的血液样本(n = 123913)采用基于测序的分型方法进行 HLA I 类和 II 类基因分型。我们发现 HLA-A11:01、B40:01、C01:02、DQB103:01 和 DRB109:01 在中国流行。此外,与对照组相比,三个高频等位基因(DQB103:01、DQB106:02 和 DRB115:01)在恶性血液病中具有危害性。另外,对于良性血液病,7 个高频风险等位基因(A01:01、B46:01、C01:02、DQB103:03、DQB105:02、DRB109:01 和 DRB114:54)和 8 个高频易感基因型(A11:01-

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 12.11 MB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0281698.s008。

【主题与分类】

源站学科分类:Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Environmental Sciences not elsewhere classified、Chemical Sciences not elsewhere classified、Ecology。主题标签:received little attention、ii using sequencing、human leukocyte antigen、malignant hematologic diseases、benign hematologic disorders、frequency risk alleles、frequency susceptible genotypes、hla susceptibility alleles、frequency alleles、hla alleles。本站分类:血液与淋巴系统疾病/良性血液病。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Environmental Sciences not elsewhere classified、Chemical Sciences not elsewhere classified、Ecology。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/The_minimal_data_set_/25570565

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Li, Ye-Mo; Li, Yu-Xia; Li, Dai-Yang; Zhou, Ying; An, Lin; Yuan, Zhi-Yang; et al. (2024). The minimal data set.. PLOS ONE. Dataset

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数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "pone.0281698.s008.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/45557459"

文件清单

  • pone.0281698.s008.xlsx(12.11 MB)

文件总体积 12.11 MB(源站 API 实测)。

数据说明

目前已鉴定出多个参与该病发病机制的基因,其中人类白细胞抗原(HLA)系统发挥重要作用。然而,HLA与一组血液系统疾病之间的关系在中国鲜有关注。我们采用基于测序的分型方法,对来自43568例患者和80345例无已知病理个体的血液样本(n = 123913)进行了HLA I类和II类基因分型。我们发现HLA-A11:01、B40:01、C01:02、DQB103:01和DRB109:01在中国人群中较为常见。此外,与对照组相比,三个高频等位基因(DQB103:01、DQB106:02和DRB115:01)在恶性血液病中具有危险性。此外,对于良性血液病,观察到7个高频风险等位基因(A01:01、B46:01、C01:02、DQB103:03、DQB105:02、DRB109:01和DRB114:54)和8个高频易感基因型(A11:01-A11:01、B46:01-B58:01、B46:01-B46:01、C01:02-C03:04、DQB103:01-DQB105:02、DQB103:03-DQB106:01、DRB109:01-DRB115:01和DRB114:54-DRB1*15:01)。

总之,我们的发现表明HLA等位基因/基因型与多种血液系统疾病之间存在关联,这对于疾病监测至关重要。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0281698.s008(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/The_minimal_data_set_/25570565)。

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