UAE 基因型数据集

数据覆盖基因组变异信息,主题标签为 Genomics,本站分类归入血液与淋巴系统疾病下的贫血。可用于群体遗传学分析、基因型与表型关联研究,以及贫血等血液相关疾病的遗传机制探索(来源 omicsdi.org)

omicsdi
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基因组分类Genomics
UAE genotype dataset

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-09

资源简介

UAE 基因型数据集

UAE genotype dataset 是一个面向基因组变异信息的基因型数据集,收录于 omicsdi.org,并在本站分类中归入血液与淋巴系统疾病下的贫血方向。该数据集以 PLINK 处理后的 PED 和 MAP 格式提供基因型数据,样本来自阿联酋的 1000 份样本,检测平台为 Illumina Omni5 Exome Bead Chip。主题标签为 Genomics,整体定位偏向群体遗传学与疾病遗传机制研究。对于关注阿联酋人群遗传背景、贫血等血液相关疾病遗传基础的研究者而言,该数据集提供了可用的基因型资源,可用于后续的群体结构分析、基因型与表型关联研究,以及血液相关疾病遗传机制的探索。

【数据集背景】

该数据集来自 omicsdi.org,主题标签为 Genomics,本站分类将其归入血液与淋巴系统疾病下的贫血。从来源描述看,它属于基因型数据资源,围绕阿联酋人群样本展开。基因组变异信息是其主要内容,因而适合用于群体遗传学分析和基因型与表型关联研究。贫血作为本站分类所指向的疾病方向,提示该数据集可用于贫血等血液相关疾病的遗传机制探索。源站未提供更详细的研究背景、项目立项信息或所属具体课题。

【数据内容】

该数据集包含 PLINK 处理后的基因型数据,具体为 PED 和 MAP 格式。样本数量为 1000 份,样本来自阿联酋。检测平台为 Illumina Omni5 Exome Bead Chip。数据覆盖基因组变异信息,主题标签为 Genomics。除上述内容外,源站未提供关于变异位点数量、基因覆盖范围、具体表型字段、样本分组信息或数据文件大小的进一步说明。

【采集与来源】

样本来源为阿联酋,共 1000 份样本。检测使用 Illumina Omni5 Exome Bead Chip。数据经过 PLINK 处理,以 PED 和 MAP 格式提供。来源站为 omicsdi.org。源站未提供样本采集时间、采集机构、伦理审批信息、知情同意情况或具体合作单位等细节。

【适用场景】

该数据集可用于群体遗传学分析、基因型与表型关联研究,以及贫血等血液相关疾病的遗传机制探索。由于数据以 PLINK 格式提供,适合开展需要基因型矩阵的遗传关联分析、群体结构评估和变异层面探索。本站分类将其归入血液与淋巴系统疾病下的贫血,因此对贫血相关遗传研究具有潜在参考价值。源站未提供其他具体应用案例或已验证的分析结论。

【使用方法】

该数据集以 PLINK 处理后的 PED 和 MAP 格式提供,使用者可依据 PLINK 相关流程读取和处理。源站未提供具体下载方式、访问链接、软件版本要求、数据处理脚本或分析参数建议。若需使用,应结合自身研究目的和合规要求进行后续处理。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量、缺失率、基因分型准确性、样本排除标准或批次效应的说明。该数据集样本量为 1000 份,来源为阿联酋,使用 Illumina Omni5 Exome Bead Chip 平台,这些信息构成其基本范围。源站未提供数据更新频率、版本信息或已知技术限制。使用者应自行评估数据是否满足具体研究需求。

【引用与许可】

源站未提供引用方式、许可协议、使用限制或数据访问政策。使用者应遵循来源站 omicsdi.org 及相关数据提供方的要求。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00010001886

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含经PLINK处理的(PED和MAP)基因型数据,来自阿联酋的1000个样本,使用Illumina Omni5 Exome Bead Chip芯片。

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