COPII 基因旁系同源物 SEC23A 与 SEC23B 的功能在体内可互换

该数据集来自 omicsdi.org,围绕 COPII 基因旁系同源物 SEC23A 与 SEC23B 展开,包含针对这两个蛋白的 BioID 实验数据

omicsdi
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基因组Proteomics
The Functions of the COPII Gene Paralogs SEC23A and SEC23B Are Interchangeable In Vivo

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-09

资源简介

COPII 基因旁系同源物 SEC23A 与 SEC23B 的功能在体内可互换

该数据集围绕COPII基因旁系同源物SEC23A与SEC23B展开,包含针对这两个蛋白的BioID实验数据,用于支撑关于二者功能冗余性的研究。相关研究论文描述了这两个基因旁系同源物在人类疾病背景下的功能冗余关系。数据集英文名称为“The Functions of the COPII Gene Paralogs SEC23A and SEC23B Are Interchangeable In Vivo”,在分类上归属于血液与淋巴系统疾病下的贫血方向,主题标签为蛋白质组学,来源站为omicsdi.org。整体而言,该数据集以蛋白质组学实验数据为核心,服务于对SEC23A与SEC23B在体内功能是否可互换这一科学问题的探索,并为理解其与人类疾病尤其是贫血相关疾病之间的联系提供数据基础。

【数据集背景】

COPII(coat protein complex II)是参与细胞内囊泡运输的重要复合物,SEC23A与SEC23B是其相关的两个基因旁系同源物。该数据集所对应的研究聚焦于这两个旁系同源物在体内(in vivo)的功能是否可互换,并在人类疾病的背景下讨论其功能冗余性。数据集在分类上被归入血液与淋巴系统疾病中的贫血方向,说明其研究语境与血液系统疾病相关。主题标签为蛋白质组学,表明数据以蛋白质层面的实验分析为主要内容。源站描述指出,该数据集包含针对SEC23A和SEC23B的BioID实验数据,论文则描述了这两个基因旁系同源物在人类疾病背景下的功能冗余。以上信息构成了该数据集的基本研究背景。

【数据内容】

该数据集的核心内容是针对SEC23A与SEC23B两个蛋白的BioID实验数据。BioID是一种用于邻近标记与相互作用研究的蛋白质组学方法,通过该方法可以获得与目标蛋白空间邻近的蛋白信息。数据集中同时涵盖SEC23A和SEC23B两个目标,便于对二者进行比较分析。除BioID数据这一明确内容外,数据集是否还包含其他类型的组学数据、样本数量、实验重复次数、鉴定到的蛋白数量等具体细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为omicsdi.org。源站描述说明,数据集包含SEC23A和SEC23B的BioID数据,并指出相关论文描述了这两个基因旁系同源物在人类疾病背景下的功能冗余。关于具体的样本来源、细胞或组织类型、实验平台、仪器型号、采集时间、实验地点以及具体的实验流程等信息,源站未提供。

【适用场景】

基于现有信息,该数据集适用于与SEC23A和SEC23B功能研究相关的蛋白质组学分析场景,尤其是围绕COPII复合物、囊泡运输以及基因旁系同源物功能冗余性的研究。由于数据集被归类于血液与淋巴系统疾病下的贫血方向,其也可用于与贫血相关疾病机制探索的研究语境。对于希望比较SEC23A与SEC23B邻近蛋白或相互作用特征的科研人员,该数据集提供了直接的BioID实验数据支持。关于更具体的适用分析类型、可支持的下游应用或临床转化场景,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以BioID实验数据为核心内容,使用者可围绕SEC23A与SEC23B的邻近标记结果开展蛋白质组学层面的分析。关于数据的下载方式、文件格式、数据结构、预处理步骤、分析工具与参数设置等具体使用方法,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于omicsdi.org,其内容与一篇描述SEC23A和SEC23B功能冗余性的论文相关联,并包含针对这两个蛋白的BioID数据。关于数据的完整性、覆盖率、假阳性与假阴性控制、批次效应、重复性验证、样本量大小以及可能存在的技术偏差等质量指标与限制条件,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集对应的论文描述了COPII基因旁系同源物SEC23A与SEC23B在人类疾病背景下的功能冗余,数据集本身包含针对这两个蛋白的BioID数据。关于具体的引用格式、作者列表、发表期刊、发表年份、DOI,以及数据的使用许可、分发条件与版权限制等信息,源站未提供。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000081703

标准获取流程:

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含SEC23A和SEC23B的BioID。论文描述了这两个基因旁系同源物在人类疾病背景下的功能冗余。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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