人外周血单核细胞、M-CSF处理单核细胞来源巨噬细胞及原代肺泡巨噬细胞的转录谱分析
该数据集来自 omicsdi.org，包含人外周血单核细胞（MONO）、经 M-CSF 处理的人外周血单核细胞来源巨噬细胞（MACRO）以及原代肺泡巨噬细胞（BAL）的转录谱数据
基本信息
资源简介
人外周血单核细胞、M-CSF处理单核细胞来源巨噬细胞及原代肺泡巨噬细胞的转录谱分析
该数据集聚焦于人单核细胞与巨噬细胞的转录表达谱，来源于 omicsdi.org，主题标签为 Transcriptomics。数据集涵盖三种细胞类型：人外周血单核细胞（MONO）、经 M-CSF 处理的人外周血单核细胞来源巨噬细胞（MACRO）以及原代肺泡巨噬细胞（BAL）。研究通过两两比较的方式，对来自同一个体的不同细胞类型进行配对分析，共涉及 4 名个体，获得 MONO/MACRO、MONO/BAL 和 MACRO/BAL 三组微阵列数据，每组均包含 4 个生物学重复。本站将其归类于血液与淋巴系统疾病 / 急性淋巴细胞白血病方向。以下从背景、内容、来源、应用、方法、局限及引用等方面展开介绍。
【数据集背景】
单核细胞和巨噬细胞是固有免疫系统的重要组成部分，在血液和组织中发挥吞噬、抗原呈递及细胞因子分泌等功能。为了系统研究这两类细胞在基因表达层面的差异与联系，该数据集针对人外周血单核细胞、经 M-CSF 诱导分化的人外周血单核细胞来源巨噬细胞以及原代肺泡巨噬细胞开展转录谱分析。通过同一供体来源的细胞进行配对比较，有助于减少个体间遗传背景差异带来的干扰，更集中地反映细胞类型特异的表达特征。
【数据内容】
数据集包含三种细胞类型的转录表达数据：MONO、MACRO 和 BAL。实验设计为两两配对比较，形成三组微阵列数据，即 MONO/MACRO、MONO/BAL 和 MACRO/BAL。每组比较均包含 4 个生物学重复，总计来自 4 名个体的样本。主题标签为 Transcriptomics，表明数据属于转录组学范畴。本站分类将其归入血液与淋巴系统疾病 / 急性淋巴细胞白血病。除上述信息外，源站未提供更详细的基因列表、表达值矩阵或注释文件说明。
【采集与来源】
数据来源站为 omicsdi.org。根据源站描述，研究采集了三种类型细胞，并对来自同一个人的两种细胞类型进行比较，共涉及 4 个人。所有实验均在同一供体内部进行配对比较，以获取 MONO/MACRO、MONO/BAL 和 MACRO/BAL 三组微阵列数据，每组 4 个生物学重复。关于样本采集的具体时间、地点、伦理审批信息以及个体的人口学特征，源站未提供。
【适用场景】
该数据集可用于研究单核细胞向巨噬细胞分化过程中的基因表达变化，以及不同组织来源巨噬细胞（如单核细胞来源巨噬细胞与外周血单核细胞、原代肺泡巨噬细胞）之间的转录差异。由于采用同一供体配对设计，适合用于减少个体间变异、识别细胞类型特异表达模式的分析。本站分类将其关联至血液与淋巴系统疾病 / 急性淋巴细胞白血病，可能为该类疾病中单核/巨噬细胞相关机制研究提供参考。但具体适用场景需结合源站未提供的完整实验信息进一步判断。
【使用方法】
源站未提供具体的数据使用说明、预处理步骤、归一化方法或分析流程。用户如需使用该数据集，应参考 omicsdi.org 上对应的原始记录获取下载方式与配套文档。由于数据为微阵列类型，通常需要经过背景校正、归一化及差异表达分析等步骤，但该数据集是否包含原始数据或仅提供处理后数据，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集每组比较包含 4 个生物学重复，共涉及 4 名个体，样本量较小，可能限制统计功效与结论的普适性。所有实验均为同一供体配对比较，虽然有助于控制个体差异，但无法完全排除细胞培养或处理过程中的批次效应。关于数据质量评估、缺失值情况、平台信息及验证实验，源站未提供。此外，本站分类标注为急性淋巴细胞白血病，但源站描述未明确说明该数据集与急性淋巴细胞白血病的直接关系，使用时需谨慎解读。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式、许可协议或使用条款。用户在使用前应访问 omicsdi.org 查询原始记录，确认相关的引用要求与数据共享政策。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MEXP-524
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
为了研究单核细胞和巨噬细胞的基因表达谱，我们收集了三种类型的细胞并进行了两两比较。这三种细胞包括人外周血单核细胞（MONO）、经M-CSF处理的人外周血单核细胞衍生巨噬细胞（MACRO）以及原代肺泡巨噬细胞（BAL）。所有实验均在同一人的三种细胞类型中选取两种进行比较（共4人）。总共我们获得了三组微阵列数据，即MONO/MACRO、MONO/BAL和MACRO/BAL，每组均有4个生物学重复。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
