野生型MLL婴儿急性淋巴细胞白血病基因表达数据集

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-58565

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

野生型MLL婴儿急性淋巴细胞白血病的广泛分子与预后特征研究。背景：在所有婴儿急性淋巴细胞白血病（ALL）病例中，约20%携带野生型（或生殖细胞系）MLL基因。迄今为止，野生型MLL婴儿ALL患者通常被视为年幼的儿童前体B-ALL患者，但对该特定患者群体的广泛特征描述在很大程度上仍未得到充分认识。方法：我们在此研究了相对较大队列的78例野生型MLL婴儿ALL样本，采用临床参数、微阵列比较基因组杂交分析、基因表达谱分析、多重连接依赖探针扩增以及常规测序技术。发现：野生型MLL婴儿ALL患者的一般特征为有利预后因素的发生率低于儿童（非婴儿）B-ALL患者，且治疗失败高风险患者通常表现为不成熟的前B细胞免疫表型或对泼尼松反应不佳。

通过基因表达谱分析，我们发现MEIS1表达对野生型MLL婴儿急性淋巴细胞白血病（ALL）的临床结局具有高度预测价值，在MEIS1低表达的野生型MLL婴儿中预后良好（无病生存率88%对50%，p=0.01）。总体而言，与儿童前体B-ALL患者相比，野生型MLL婴儿ALL患者中DNA拷贝数变异及B细胞分化相关基因遗传异常的发生率较低。解读：野生型MLL婴儿ALL代表一个高度异质性的患者群体，无法用一或少数已知的复发性基因组畸变来统一归类。在高危野生型MLL婴儿ALL患者中，高水平MEIS1表达及未成熟pro-B免疫表型与MLL重排婴儿ALL患者的不良预后相一致。相反，表达较低水平MEIS1并显示更分化（pre-B或common）表型的野生型MLL婴儿ALL患者可能更多地与儿童前体B-ALL相关。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。