着丝粒蛋白E作为视网膜母细胞瘤新型生物标志物和潜在治疗靶点数据集
该数据集整合了来自公共数据库的多个基因表达数据集，包含视网膜母细胞瘤相关的基因表达、蛋白质相互作用、免疫细胞浸润和调控网络等多模态数据，主要用于识别视网膜母细胞瘤的核心生物标志物（如CENPE等六个枢纽基因）和潜在治疗靶点，支持癌症靶向治疗、免疫学分析和药物敏感性研究。
创建时间2021-12-31
更新时间2024-02-16
原始链接
https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Centromere_protein_E_as_a_novel_biomarker_and_potential_therapeutic_target_for_retinoblastoma/16571378/2
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资源简介
该数据集聚焦于儿童期最常见的眼内恶性肿瘤——视网膜母细胞瘤，旨在探索其生物标志物和潜在治疗靶点。数据集整合了来自公共数据库的三个独立数据集，通过功能富集分析（如基因本体论、KEGG通路、基因集富集分析和变异分析）揭示了视网膜母细胞瘤中差异表达基因在细胞周期加速事件中的富集情况。蛋白质-蛋白质相互作用分析构建了一个包含六个核心基因（BUB1、CDK1、CENPE、KIF20A、PBK、TPX2）的网络。研究进一步分析了CENPE的调控机制（包括非编码RNA和转录因子）、免疫细胞浸润（特别是浆细胞和B细胞）与CENPE表达的关系，并进行了泛癌分析。体外实验验证了CENPE在视网膜母细胞瘤细胞中mRNA和蛋白水平上的显著上调。该数据集主要用于视网膜母细胞瘤的生物标志物发现、靶向治疗研究和癌症免疫学分析。
提供机构：Sun, Xiaodong; Wu, Jiali; Zhu, Xinyue; Chen, Yuhong; Zhang, Jingfa; Shi, Ke
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