Shanghai

眼科OCT、眼底彩照和SLO影像数据集,含视网膜9层分割标签,用于眼底疾病诊断和视网膜分层分割。

KaphathyKaphathy
HuggingFace
2026-08-31 更新
浏览 28
医学影像region:us
Shanghai

基本信息

模态
医学影像
大小
1165.616341431 GB
数据量
128
创建/更新时间
2026-08-31

资源简介

Shanghai

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Kaphathy/Shanghai》。源站首次发布:2026-08-29。

【数据内容】

源站原始描述:# Shanghai Eye Disease Center Ophthalmic Multimodal Dataset (上海市眼病防治中心多模态眼科数据集) A comprehensive, multi-center, longitudinal ophthalmic foundation dataset from Shanghai Eye Disease Prevention & Treatment Center. ## Repository Layout ```text Kaphathy/Shanghai/ └── Topcon/ └── shards/ ├── manifest.json # O(1) Index mapping each exam_id to its shard ├── meta.tar.gz # Complete clinical JSON metadata for all 30,711 exams (3.3 MB) ├── labels/ # 62 TAR shards containing 2,133,834 pixel-level segmentatio…

【数据结构与技术规格】

文件数 126 个,合计 801.23 GB。

【主题与分类】

主题标签:region:us。

【适用方向】

影像类数据可用于医学图像分析模型(检测、分割、分类)的训练与评测,也可用于标注质量与成像参数相关性的研究。

【获取与许可】

源站页面:https://huggingface.co/datasets/Kaphathy/Shanghai

【使用注意】

· 源站最后修改于 2026-09-16,引用时请注意版本时效。

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取与加载(Hugging Face datasets)

# 前置依赖: pip install datasets
from datasets import load_dataset

ds = load_dataset("Kaphathy/Shanghai")
print(ds)  # 查看 splits 与字段结构
# 国内网络可先设镜像: import os; os.environ["HF_ENDPOINT"]="https://hf-mirror.com"
git lfs install && git clone https://hf-mirror.com/datasets/Kaphathy/Shanghai

数据说明

眼科OCT、眼底彩照和SLO影像数据集,包含视网膜9层分割标签(uint8索引PNG),提供元数据(尺寸、扫描模式、质量等),适用于眼底疾病诊断、视网膜分层分割等医学影像分析任务。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

完整数据卡:huggingface.co/datasets/Kaphathy/Shanghai

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