胶质瘤空间组学数据集
该数据集是一个包含胶质母细胞瘤和IDH突变胶质瘤样本的空间组学数据集,数据模态包括通过10x Visium获取的空间转录组数据和通过CODEX技术获取的高维多蛋白空间成像数据,主要用途是研究胶质瘤的肿瘤微环境、空间异质性、生物标志物发现以及空间多组学整合分析,适用于肿瘤生物学和精准医学研究。

基本信息
资源简介
胶质瘤空间组学数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Glioma spatialomics dataset》。源站首次发布:2024-02-19。
【数据内容】
源站原始描述:See visium_dataset_description.csv and readme_CODEX.txt Thirteen fresh frozen GBM samples profiled by 10x Visium Six fresh frozen IDH mutant samples profiled by 10x Visium Twelve fresh frozen GBM samples profiled by CODEX One GBM organoid model profiled by CODEX
【数据结构与技术规格】
文件数 37 个,合计 25.31 GB。数据集 DOI:10.5281/zenodo.10680513。
【获取与许可】
源站页面:https://zenodo.org/records/10680513
使用许可:cc-by-4.0。
下载信息
注册下载
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
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提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取(Zenodo 公开直链)
源站:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.10680513
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数据说明
该数据集是一个公开的医学空间组学数据集,专注于胶质母细胞瘤(GBM)和IDH突变胶质瘤。数据集包含以下内容:13个新鲜冷冻GBM样本通过10x Visium平台进行空间转录组分析;6个新鲜冷冻IDH突变样本通过10x Visium分析;12个新鲜冷冻GBM样本通过CODEX(Co‑Detection by indEXing)技术进行高维多蛋白空间成像;以及1个GBM类器官模型通过CODEX分析。数据来源于新鲜冷冻组织样本和类器官模型,采用前沿的空间组学技术构建。主要研究方向包括胶质瘤的肿瘤微环境解析、空间异质性研究、生物标志物发现以及空间多组学整合分析,适用于肿瘤生物学、精准医学和空间组学方法学开发。
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