289种表型流行率数据集

该数据集是一个整合了OMIM、ClinVar、Orphanet和GTR等多个权威数据库的基因-表型关联分析数据集,主要包含与遗传性代谢疾病相关的228个明确基因及其对应的表型流行率、染色体分布、致病性变异负荷和遗传模式等多模态信息,旨在通过构建基于证据的诊断面板(如关注不足面板和初始筛查面板)来提升遗传性代谢疾病的临床诊断准确性和效率,支持精准医疗和早期干预。

Figshare
2025-08-29 更新
遗传性代谢疾病诊断基因-表型关联分析
创建时间2025-08-29
更新时间2025-08-29
原始链接

https://figshare.com/articles/dataset/Prevalence_of_the_289_phenotypes_/30012936

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资源简介

该数据集聚焦于遗传性代谢疾病(IMDs)的基因-表型关联分析,旨在将大规模基因组数据转化为临床可操作的诊断工具。数据集基于OMIM、ClinVar、Orphanet和遗传检测登记库(GTR)中的权威数据构建,系统性地梳理了372个OMIM条目,从中确定了228个与代谢疾病明确相关的基因(GAMD)。数据内容涵盖基因的染色体分布、致病性变异负荷、表型聚类模式(尤其在氨基酸代谢疾病中),以及遗传模式(以常染色体隐性遗传为主)。通过整合变异致病性、表型流行率和诊断测试可及性,数据集支持构建了两个基于证据的诊断面板:一个为'关注不足面板',用于突出检测不足但临床相关且与高流行率IMDs相关的基因;另一个为'初始筛查面板',优先选择致病性变异比例高、检测可及性强且临床相关性显著的基因,为一线诊断提供高效工具。该数据集的主要研究方向是提升遗传性代谢疾病的诊断准确性、支持早期干预,并促进疾病管理的公平性。

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