单细胞RNA-seq揭示原发性开角型青光眼细胞类型特异性分子与遗传关联

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.17114800

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 1.22 GB。

数据说明

原发性开角型青光眼（POAG）研究外周血PBMC样本的单细胞RNA测序数据 本数据集包含采用10X Genomics技术对218份样本（POAG病例与对照）进行处理后获得的单细胞RNA测序数据。该数据支持发表于《Single-cell RNA-seq reveals cell type-specific molecular and genetic associations with primary open-angle glaucoma》（已被《Signal Transduction and Targeted Therapy，STTT》接收发表）的研究。

数据集内容：单个样本文件：218个干净的h5ad文件（每个样本一个），包含处理后的单细胞表达矩阵样本元数据：完整的样本信息，包括病例/对照状态、人口学数据和临床特征数据格式：标准化的h5ad格式，兼容scanpy、Seurat及其他单细胞分析工具质量控制：经过预处理的数​​据，已应用细胞过滤、基因过滤和基本质量指标技术细节：样本类型：外周血单核细胞（PBMC）测序技术：10X Genomics单细胞RNA测序样本量：218个样本（POAG病例和对照）文件格式：h5ad（AnnData格式）处理：干净、经过滤和归一化的单细胞表达数据用途：该数据集适用于单细胞分析，包括细胞类型鉴定、差异表达分析、轨迹分析以及与遗传数据的整合用于POAG研究。数据可直接加载到流行的单细胞分析框架中，如scanpy、Seurat或Scanpy。

相关发表：“单细胞RNA测序揭示与原发性开角型青光眼相关的细胞类型特异性分子和遗传关联”（已被《信号转导与靶向治疗》接受发表）

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。