青光眼基因与环境(GLAUGEN)研究

该数据可用于青光眼相关的病例对照分类研究,并支持基因与环境因素关联分析(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。本站分类:眼及附器疾病/青光眼

dbgap
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基因组分类Case-Control
phs000308: The Glaucoma Genes and Environment (GLAUGEN) Study

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

青光眼基因与环境(GLAUGEN)研究

phs000308 即 The Glaucoma Genes and Environment (GLAUGEN) Study,是一项以青光眼为主题的病例对照研究数据集,收录于 NCBI 的 dbGaP 数据库,并在本站归入眼及附器疾病 / 青光眼分类。该数据集的核心设计为病例对照,围绕青光眼这一致盲性眼病,支持病例与对照的分类研究,并可用于基因与环境因素的关联分析。青光眼是一类以视神经损害和视野缺损为特征的疾病,遗传易感性与环境暴露在其发生发展中均可能发挥作用,因此同时纳入遗传信息与环境信息的病例对照资源在该领域具有明确的研究价值。该数据集适合作为青光眼遗传流行病学与基因—环境交互研究的素材,其原始描述与数据获取途径指向 ncbi.nlm.nih.gov。

【数据集背景】

该数据集对应 dbGaP 中的一项研究,英文全称为 The Glaucoma Genes and Environment (GLAUGEN) Study,研究编号为 phs000308。从名称可以看出,该研究关注青光眼的基因因素与环境因素,采用病例对照(Case-Control)的研究设计。青光眼属于眼及附器疾病范畴,本站将其归入青光眼分类。源站将其描述为 dbGaP study (Case-Control),主题标签同样为 Case-Control,说明病例对照是该数据集最基本的设计特征。关于该研究的具体立项背景、研究机构、招募地区与时间跨度,源站未提供。

【数据内容】

该数据集的主题标签为病例对照,表明其数据组织围绕病例组与对照组的划分展开。结合研究名称与短描述,数据内容可支持青光眼相关的病例对照分类研究,并支持基因与环境因素的关联分析。也就是说,数据中应包含可用于区分青光眼病例与对照的表型信息,以及用于遗传分析和环境暴露分析的相关内容。关于具体的样本量、基因分型平台、位点数量、环境变量条目、随访次数等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP 收录的研究,编号 phs000308。dbGaP 是 NCBI 维护的基因型与表型数据库,通常用于存储和分发受控访问的人类遗传研究数据。该研究的源站描述为 dbGaP study (Case-Control)。关于样本采集的具体地点、人群来源、伦理审批信息以及数据提交单位,源站未提供。

【适用场景】

基于其病例对照设计与基因—环境研究定位,该数据集适用于以下方向:青光眼病例与对照的分类研究;青光眼相关基因与环境因素的关联分析;遗传流行病学中病例对照设计的方法学应用。由于主题标签明确为 Case-Control,该数据也适合作为比较病例组与对照组在遗传或环境暴露特征上差异的研究素材。关于该数据是否适用于其他眼科疾病或跨疾病比较,源站未提供。

【使用方法】

该数据集通过 ncbi.nlm.nih.gov 的 dbGaP 平台提供。dbGaP 数据通常需要按照该平台的访问流程申请获取,具体的数据访问级别、申请条件与下载方式应以源站说明为准。关于该数据集的具体文件格式、配套分析工具与推荐分析流程,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 dbGaP 收录的病例对照研究,其设计特征明确。关于样本质量评估、基因分型质控指标、缺失率、重复样本一致性等信息,源站未提供。使用时应注意到病例对照设计本身的固有限制,例如对照选择与暴露回忆偏倚等问题,但该数据集的具体质量控制结果与已知局限,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 dbGaP 平台,研究编号为 phs000308。使用该数据集时应遵循 dbGaP 的数据使用与引用规范,具体的数据使用协议、许可条款与推荐引用格式,源站未提供。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000308

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

dbGaP study (Case-Control).

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