基于广域OCT的疾病进展数据集

该数据集为在非人灵长类单侧实验性青光眼模型上采集的广域OCT数据,Matlab文件包含视网膜神经纤维层与神经节细胞内丛状层的配准厚度图

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图像图像分割Medicine, Health and Life Sciences
Disease Progression Using Widefield OCT

基本信息

模态
图像
任务类型
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创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

基于广域OCT的疾病进展数据集

Disease Progression Using Widefield OCT 是一个面向青光眼相关眼科研究的数据集,收录了在非人灵长类单侧实验性青光眼模型上采集的广域光学相干断层扫描(OCT)数据。数据集以 Matlab 文件形式提供,核心内容为视网膜神经纤维层与神经节细胞内丛状层的配准厚度图,可用于观察和量化实验性青光眼条件下视网膜结构随疾病进展的变化。该数据集归属于眼及附器疾病中的青光眼方向,主题标签为医学、健康与生命科学,由作者 Nimesh Patel 提交,机构来源为 Texas Data Repository,来源站为 doi.org,发布时间为 2026 年。相关研究已发表于 TVST 期刊。

【数据集背景】

青光眼是一类以视网膜神经节细胞及其轴突进行性损伤为特征的视神经病变,视网膜神经纤维层和神经节细胞内丛状层的厚度变化是评估结构损伤的重要观察对象。该数据集围绕非人灵长类的单侧实验性青光眼模型构建,旨在以广域 OCT 成像方式记录疾病进展过程中的视网膜结构改变。源站描述指出,相关研究已发表在 TVST 上,说明该数据对应一项已公开发表的研究工作。数据集被归入眼及附器疾病下的青光眼分类,主题标签为医学、健康与生命科学,适合作为青光眼结构损伤研究的基础数据资源。

【数据内容】

数据集以 Matlab 文件形式组织,内容包括视网膜神经纤维层和神经节细胞内丛状层的配准厚度图。配准意味着不同时间点或不同条件下的厚度图经过空间对齐,便于在同一空间参考下比较相应区域的厚度变化。数据来自广域 OCT 采集,覆盖范围较常规 OCT 更广,有助于在较大视网膜区域内观察结构改变。除上述内容外,各文件的具体命名规则、文件数量、受试动物个体数量、时间点设置、图像尺寸与分辨率等信息,源站未提供。

【采集与来源】

数据采集对象为非人灵长类的单侧实验性青光眼模型,成像方式为广域 OCT。数据集由 Patel, Nimesh 提交,机构来源为 Texas Data Repository,来源站为 doi.org,发布时间为 2026 年。关于采集设备型号、扫描参数、麻醉与固定方案、实验性青光眼的诱导方法、采集时间间隔与随访周期等具体细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于青光眼结构损伤相关的研究场景,例如分析实验性青光眼模型中视网膜神经纤维层与神经节细胞内丛状层厚度的空间分布及其随疾病进展的变化,比较不同区域对损伤的敏感性差异,以及为厚度图配准、分割和变化检测等方法提供测试数据。由于数据来自非人灵长类模型,也可用于动物模型与临床青光眼结构评估之间的对照性方法研究。关于该数据集在其他具体任务上的适用性,源站未提供。

【使用方法】

使用者可通过来源站 doi.org 获取数据集,并在 Matlab 环境中读取其中的文件,以获得视网膜神经纤维层与神经节细胞内丛状层的配准厚度图,进而开展厚度分析或方法验证。使用时应结合已发表的研究理解数据的组织方式与分析流程。关于文件的具体读取方式、变量命名、单位定义以及配套分析代码,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集基于非人灵长类单侧实验性青光眼模型,样本来源与实验条件具有特定性,向其他物种或临床人群推广时需谨慎。数据仅包含视网膜神经纤维层与神经节细胞内丛状层的配准厚度图,未涵盖其他视网膜层或功能指标。关于数据完整性、缺失情况、配准精度评估、重复测量一致性以及样本量等质量相关信息,源站未提供。

【引用与许可】

使用该数据集时应引用相关已发表研究,该研究发表于 TVST。数据集的作者为 Patel, Nimesh,机构来源为 Texas Data Repository,来源站为 doi.org,发布时间为 2026 年。关于具体的许可条款、使用限制与推荐引用格式,源站未提供。

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源站:https://doi.org/10.18738/T8/HQNAOX

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在非人灵长类动物单侧实验性青光眼研究中采集的宽场OCT数据。Matlab文件包含视网膜神经纤维层和神经节细胞内丛状层的配准厚度图。该研究发表于TVST。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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