POAG分析与临床数据队列数据集

该数据集包含经实时PCR评估的变异(LMX1B位点的rs3829849和TMCO1位点的rs2790053)的筛选过程,以及根据数据保护法规复现研究结果所需的临床数据

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基因组回归青光眼原发性开角型青光眼遗传变异临床数据实时PCR统计分析
Dataset POAG analysis and clinical data cohort

基本信息

模态
基因组
任务类型
回归
创建/更新时间
2026-10-18

资源简介

POAG分析与临床数据队列数据集

Dataset POAG analysis and clinical data cohort 是一个面向原发性开角型青光眼(POAG)遗传关联研究的科研数据集,收录了经实时PCR评估的两个单核苷酸变异——LMX1B位点的rs3829849与TMCO1位点的rs2790053——的筛选过程资料,以及按照数据保护法规要求、用于复现研究结论所需的临床数据。该数据集由八个合作中心共同参与的研究产生,患者招募时间为2004年至2025年,统计分析涵盖线性回归、逻辑回归、二元逻辑回归及Hardy-Weinberg平衡检验,显著性水平设定为α < 0.05,并针对两个SNV采用Bonferroni校正阈值控制多重检验。数据集由Repositório de Dados de Pesquisa da Unicamp发布,发布时间为2026年,本站归类于眼及附器疾病下的青光眼方向。

【数据集背景】

原发性开角型青光眼是一种需要长期临床管理与遗传学机制探索的眼科疾病。该数据集所依托的研究通过八个合作中心,于2004年至2025年间招募原发性开角型青光眼患者,围绕LMX1B与TMCO1两个基因位点的变异开展关联分析。研究设计包含实时PCR对候选变异的评估与筛选,并配套收集临床数据以支持结果复现。统计分析方法的选用覆盖线性回归、逻辑回归、二元逻辑回归以及Hardy-Weinberg平衡检验,显著性水平设为α < 0.05;考虑到同时考察两个SNV,研究采用Bonferroni校正阈值α/m(α = 0.05,m = 2),即校正后显著性水平为p < 0.025,以控制多重检验带来的假阳性风险。

【数据内容】

数据集由两大部分构成。其一是经实时PCR评估的变异筛选过程资料,涉及LMX1B位点的rs3829849和TMCO1位点的rs2790053两个变异;其二是复现研究结果所需的临床数据,这部分数据的组织与提供需符合数据保护法规的要求。源站描述未进一步说明变异筛选过程资料的具体文件形式、临床数据所包含的变量字段及其编码方式。

【采集与来源】

数据来源于八个合作中心共同开展的研究,患者招募时间跨度为2004年至2025年,研究对象为原发性开角型青光眼患者。数据经由Repositório de Dados de Pesquisa da Unicamp发布,来源站为doi.org。数据集的作者包括Gonçalves, Gabrielle Maria Giovanna da Silva、Melo, Mônica Barbosa de、Vasconcellos, José Paulo Cabral de以及Rodrigues, Thiago Adalton Rosa。各中心的具体名称、地理分布及样本量分配,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于原发性开角型青光眼遗传关联研究的复现与二次分析,尤其是围绕LMX1B位点rs3829849和TMCO1位点rs2790053两个变异的研究。由于同时提供变异筛选过程与临床数据,可用于检验实时PCR变异筛选流程的可重复性,以及在此基础上开展线性回归、逻辑回归、二元逻辑回归和Hardy-Weinberg平衡检验等统计分析。对于需要按照Bonferroni校正(α = 0.05,m = 2,p < 0.025)进行多重检验控制的研究,该数据集提供了对应的分析框架与数据基础。

【使用方法】

使用该数据集时,可依据变异筛选过程资料复现实时PCR对rs3829849与rs2790053的评估与筛选步骤,并结合临床数据开展关联分析。统计分析可沿用线性回归、逻辑回归、二元逻辑回归及Hardy-Weinberg平衡检验等方法;在显著性判断上,应遵循研究设定的α < 0.05水平,并对两个SNV采用Bonferroni校正阈值p < 0.025。使用临床数据时须遵守数据保护法规的相关要求。具体的文件格式、变量说明、分析脚本及操作步骤,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集覆盖八个合作中心、时间跨度达2004年至2025年,并采用Bonferroni校正控制多重检验,在设计与统计层面具有相应考量。其限制在于:数据集仅涉及两个SNV位点,研究结论的外推范围受此约束;临床数据的可用性受数据保护法规约束,可能影响数据的完整获取与共享;此外,源站未提供样本量、缺失数据情况、质量控制指标及数据版本更新等信息,使用前需自行评估数据适用性。

【引用与许可】

引用该数据集时,应参考其英文名称Dataset POAG analysis and clinical data cohort、作者Gonçalves, Gabrielle Maria Giovanna da Silva、Melo, Mônica Barbosa de、Vasconcellos, José Paulo Cabral de、Rodrigues, Thiago Adalton Rosa,以及发布机构Repositório de Dados de Pesquisa da Unicamp和发布时间2026年,并通过doi.org获取正式引用信息。关于许可条款、使用权限及再分发条件,源站未提供。

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源站:https://doi.org/10.25824/redu/xangud

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集既包含通过实时PCR评估的变异位点的筛选过程(LMX1B基因座的rs3829849和TMCO1基因座的rs2790053),也包含根据数据保护法规复现研究结果所需的临床数据。本研究通过八个合作中心开展,这些中心在2004年至2025年间招募了原发性开角型青光眼(POAG)患者。统计分析包括线性回归、逻辑回归、二元逻辑回归和Hardy-Weinberg平衡检验,显著性水平设定为α < 0.05。鉴于研究了两个SNV,统计显著性采用Bonferroni校正阈值来定义,以控制多重检验,计算公式为α/m,其中α = 0.05,m = 2,得出校正后的显著性水平为p < 0.025。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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