坦桑尼亚人瘢痕性沙眼结膜转录组
该数据集来自 ebi.ac.uk，为坦桑尼亚人瘢痕性沙眼的结膜转录组微阵列数据，包含41个样本（TSI 13例、TS 15例、C 14例），样本为睑结膜拭子，用于RNA提取和Ct PCR
基本信息
资源简介
坦桑尼亚人瘢痕性沙眼结膜转录组
The conjunctival transcriptome in scarring trachoma for Tanzanians
该数据集来自 ebi.ac.uk，为坦桑尼亚人瘢痕性沙眼的结膜转录组微阵列数据，包含41个样本（TSI 13例、TS 15例、C 14例），样本为睑结膜拭子，用于RNA提取和Ct PCR。研究比较有炎症（TSI）、无炎症（TS）的沙眼性结膜瘢痕患者与对照组的结膜基因表达谱，发现病例组富集促炎细胞因子和趋化因子、基质金属蛋白酶及角化包膜/鳞状化生相关成分。数据可用于探索沙眼免疫纤维化发病机制及宿主反应相关研究（来源 BioStudies）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：沙眼是一种了解甚少的免疫纤维化疾病过程，由沙眼衣原体（Ct）引发。研究了坦桑尼亚人中伴有（TSI）和不伴有（TS）炎症的沙眼性结膜瘢痕患者与对照组（C）之间结膜基因表达谱的差异，以识别相关的宿主反应。采集睑结膜拭子样本用于RNA分离和Ct PCR。对41个样本（TSI 13、TS 15、C14）进行了全转录组微阵列实验。病例组富集促炎细胞因子和趋化因子（IL1B、IL8、CXCL5、CCL20）；基质金属蛋白酶（MMP7、MMP9、MMP12）；角化包膜/鳞状化生的成分（SPRR2a、SPRR2F）。病例对照研究。结膜拭子样本采集自伴有（TSI）和不伴有（TS）临床可见炎症的沙眼性结膜瘢痕患者
【主题与分类】
主题标签：transcription profiling by array、Homo sapiens。本站分类：眼病/其他。
【获取与许可】
源站页面：https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-24383
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- OpenDataLab:
数据说明
E-GEOD-24383 坦桑尼亚人瘢痕性沙眼结膜转录组阵列转录谱分析 EFO EFO_0002768 智人 沙眼是一种了解甚少的免疫纤维化疾病过程，由沙眼衣原体（Ct）引发。结膜基因表达的差异
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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