干细胞来源视网膜神经节细胞的单细胞RNA测序
该数据集来自ebi.ac.uk，包含人胚胎干细胞系BRN3B-mCherry A81-H7经引导分化得到的视网膜神经节细胞（RGCs），在分化第36天用THY1抗体孵育并FACS分选后，对THY1阳性和阴性细胞进行单细胞RNA测序，共刻画1,174个细胞的转录组
基本信息
资源简介
干细胞来源视网膜神经节细胞的单细胞RNA测序
Single cell RNA sequencing of stem cell-derived retinal ganglion cells
该数据集来自ebi.ac.uk，包含人胚胎干细胞系BRN3B-mCherry A81-H7经引导分化得到的视网膜神经节细胞（RGCs），在分化第36天用THY1抗体孵育并FACS分选后，对THY1阳性和阴性细胞进行单细胞RNA测序，共刻画1,174个细胞的转录组。数据可用于研究RGC分化过程中的细胞异质性、比较THY1阳性与阴性群体的转录差异，以及单细胞水平的基因表达分析（来源 BioStudies）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：我们使用人胚胎干细胞来源的视网膜神经节细胞（RGCs），在单细胞水平上刻画了1,174个细胞的转录组。人胚胎干细胞系BRN3B-mCherry A81-H7通过引导分化方法分化为RGCs。细胞在第36天收获，并在进行FACS之前与THY1抗体（Miltenyi）孵育。随后，THY1阳性和THY1阴性细胞被制备用于单细胞RNA测序。按照Chromium Single Cell 3' v2 Library（10X Genomics；PN-120233）的制造商方案，将单细胞悬液与逆转录预混液一起加载到10X Genomics Single Cell 3'芯片上，以生成单细胞凝胶珠乳液。随后，文库在Illumina HiSeq 2500上测序。
【主题与分类】
主题标签：RNA-seq of coding RNA from single cells、differential、Homo sapiens。本站分类：眼及附器疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-MTAB-6108
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- OpenDataLab:
数据说明
E-MTAB-6108 干细胞来源视网膜神经节细胞的单细胞RNA测序 单细胞编码RNA的RNA-seq EFO EFO_0005684 差异 智人 我们使用人胚胎干细胞来源的视网膜神经节细胞（RGCs）来表征1,174个细胞在单细胞水平的转录组
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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