成人人神经视网膜单细胞RNA-seq
该数据集为成人人神经视网膜的单细胞RNA测序数据,来源于三名供者死后获取的20,009个细胞,构建了参考转录组图谱。通过无监督聚类分析,识别出18个转录上不同的细胞簇,覆盖所有已知视网膜细胞类型,包括视杆细胞、视锥细胞、Müller胶质细胞、双极细胞、无长突细胞、视网膜神经节细胞、水平细胞、视网膜星

基本信息
资源简介
成人人神经视网膜单细胞RNA-seq
该数据集为成人人神经视网膜的单细胞RNA测序数据,来源于三名供者死后获取的20,009个细胞,构建了参考转录组图谱。通过无监督聚类分析,识别出18个转录上不同的细胞簇,覆盖所有已知视网膜细胞类型,包括视杆细胞、视锥细胞、Müller胶质细胞、双极细胞、无长突细胞、视网膜神经节细胞、水平细胞、视网膜星形胶质细胞和小胶质细胞。该数据从整体上刻画了人视网膜的细胞类型构成,为视网膜细胞类型研究提供了参考转录组资源,属于眼及附器疾病相关分类下的数据集,主题涉及单细胞编码RNA测序与人(Homo sapiens)。
【数据集背景】
视网膜是结构复杂、细胞类型多样的神经组织,全面刻画其细胞类型构成对理解视网膜生理功能及相关疾病具有重要意义。该数据集正是为全面分析人视网膜中的细胞类型而生成,研究对成人人神经视网膜开展单细胞RNA测序,并据此构建参考转录组图谱,以转录组层面的证据系统描述视网膜内各类细胞的分布与区分。
【数据内容】
该数据集的核心内容为成人人神经视网膜的单细胞RNA测序数据,共涉及20,009个细胞。基于无监督聚类分析,数据中识别出18个转录上不同的细胞簇,这些细胞簇代表了所有已知的视网膜细胞类型,包括视杆细胞、视锥细胞、Müller胶质细胞、双极细胞、无长突细胞、视网膜神经节细胞、水平细胞、视网膜星形胶质细胞和小胶质细胞。主题标签表明其测序对象为单细胞中的编码RNA,物种为人。
【采集与来源】
数据来源于三名供者,细胞为死后获取,共20,009个细胞用于单细胞RNA测序。数据集来源站为ebi.ac.uk。除上述供者数量、细胞获取方式与细胞总数外,源站未提供更详细的采集时间、地点及处理流程信息。
【适用场景】
该数据集构建的参考转录组图谱可用于视网膜细胞类型的鉴定与参照,支持对已知视网膜细胞类型(视杆细胞、视锥细胞、Müller胶质细胞、双极细胞、无长突细胞、视网膜神经节细胞、水平细胞、视网膜星形胶质细胞和小胶质细胞)的转录组层面研究。其分类归属眼及附器疾病相关方向,可作为视网膜细胞类型相关研究的基础参考资源。更具体的应用场景源站未提供。
【使用方法】
源站未提供具体的使用方法说明。可确认的是,数据以单细胞RNA测序结果形式存在,并包含基于无监督聚类得到的18个转录上不同的细胞簇划分,可供细胞类型层面的参照使用。
【质量与限制】
该数据集基于三名供者的死后视网膜组织,共20,009个细胞,识别出18个转录上不同的细胞簇,覆盖所有已知视网膜细胞类型。受供者数量与样本来源所限,其代表性范围以源站描述为界;其他质量评估指标与限制条件源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供引用方式与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-MTAB-7316
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
E-MTAB-7316 成年人神经视网膜单细胞RNA测序 单细胞编码RNA的RNA测序 EFO EFO_0005684 智人 为了全面描绘人类视网膜中的细胞类型,我们对来自三名捐赠者死后获得的20,009个细胞进行了单细胞RNA测序,并汇编了
数据缺失?
依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。




