人γD-晶状体蛋白W42Q变体聚集物负染TEM(加/不加myo-inositol)

该数据集包含人γD-晶状体蛋白W42Q变体聚集物的负染TEM图像,该变体与白内障相关。实验设置中分别加入0、100和250 mM的myo-inositol作为聚集抑制剂,用于观察不同浓度下聚集物形态的变化

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医学影像图像分割Medicine, Health and Life Sciences
Negative-stain TEM of human gamma-D crystallin W42Q variant aggregates +/- myo-inositol

基本信息

模态
医学影像
任务类型
图像分割
创建/更新时间
2026-10-10

资源简介

人γD-晶状体蛋白W42Q变体聚集物负染TEM(加/不加myo-inositol)

该数据集收录了人γD-晶状体蛋白W42Q变体聚集物的负染透射电子显微镜(TEM)图像。人γD-晶状体蛋白是与白内障相关的蛋白,其W42Q变体在特定条件下会形成聚集物。本数据集的实验设计围绕聚集抑制剂myo-inositol展开,分别在0、100和250 mM三种浓度条件下获取图像,用以观察不同浓度myo-inositol对聚集物形态的影响。数据集归属于眼及附器疾病/其他分类,主题标签为Medicine, Health and Life Sciences,来源站为search.dataone.org。整体而言,该数据集为研究白内障相关蛋白聚集机制及抑制剂作用提供了直接的显微形态学图像资料。

【数据集背景】

白内障是与晶状体蛋白聚集密切相关的眼科疾病,人γD-晶状体蛋白是晶状体中的主要结构蛋白之一。其W42Q变体与白内障的发生相关,该变体容易发生异常聚集。myo-inositol作为一种聚集抑制剂,被用于本数据集的实验设置中,以探究其对W42Q变体聚集行为的抑制效果。数据集聚焦于在体外条件下,通过负染TEM技术观察该变体聚集物的形态特征,并比较不同浓度myo-inositol存在时的差异。这一背景使得该数据集在蛋白质聚集与眼科疾病研究的交叉领域具有潜在价值。

【数据内容】

数据集的核心内容是负染TEM图像,这些图像展示了人γD-晶状体蛋白W42Q变体聚集物的形态。实验设置了三个myo-inositol浓度组:0 mM、100 mM和250 mM。0 mM组代表未添加抑制剂的对照条件,100 mM和250 mM组则代表不同抑制浓度的实验条件。通过对比这三组图像,可以观察聚集物在有无抑制剂以及不同抑制剂浓度下的形态变化。数据集不包含除图像之外的其他数据类型,源站未提供关于图像数量、分辨率、放大倍数等具体参数。

【采集与来源】

该数据集来源于search.dataone.org。源站描述指出,数据集包含负染TEM图像,实验对象为白内障相关的人γD-晶状体蛋白W42Q变体聚集物,并分别加入0、100和250 mM myo-inositol作为聚集抑制剂。关于具体的采集设备、成像参数、样品制备流程、实验时间与地点等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于蛋白质聚集机制研究、白内障相关蛋白的体外形态学分析,以及聚集抑制剂效果评估等场景。研究人员可以利用这些负染TEM图像,观察W42Q变体在不同myo-inositol浓度下的聚集物形态差异,进而辅助判断myo-inositol对聚集过程的抑制作用。此外,该数据集也可用于教学演示或方法学参考,展示负染TEM在蛋白质聚集研究中的应用。由于数据集仅包含图像,其适用场景主要限于形态学观察和定性比较,源站未提供定量分析所需的配套数据。

【使用方法】

使用者可通过来源站search.dataone.org获取该数据集。在使用时,建议将0 mM组图像作为对照,与100 mM和250 mM组图像进行对比,以观察myo-inositol浓度变化对聚集物形态的影响。由于源站未提供图像的具体采集参数和样品制备细节,使用者在进行跨数据集比较或定量分析时需谨慎。源站未提供关于数据下载格式、文件组织方式或配套元数据的具体说明。

【质量与限制】

该数据集基于负染TEM图像,能够提供聚集物形态的直观信息,但负染TEM本身可能受到染色伪影、样品干燥过程中形态改变等因素的影响。数据集仅涵盖W42Q变体在三种myo-inositol浓度下的图像,未包含其他变体或其他抑制剂的对比数据。源站未提供图像数量、重复次数、统计分析方法等信息,因此无法评估数据的统计稳健性。此外,源站未提供关于图像分辨率、放大倍数、比例尺等关键技术参数,这限制了使用者对图像进行精确测量和定量解读的能力。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用格式和许可信息。使用者在引用或使用该数据集时,应直接访问search.dataone.org查询相关说明。

下载信息

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使用方式

数据集获取

源站:https://search.dataone.org/view/sha256%3A0d93202900879ac129fe7309147b88732fc0a9419206fbcbaad63c9b70ada23e

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含与白内障相关的人γD-晶状体蛋白W42Q变体聚集体的负染透射电镜图像,其中分别添加了0、100和250 mM的肌醇作为聚集抑制剂。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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