nAMD-OCT v1.0:新生血管性年龄相关性黄斑变性5,110张OCT B扫描六种结构的像素级标注
该数据集包含来自124例未治疗新生血管性年龄相关性黄斑变性患者的5,110张OCT B扫描,由中山大学中山眼科中心采集,并对视网膜下液、视网膜内液、色素上皮脱离、视网膜下高反射物质、外界膜和椭圆体带六种结构进行像素级标注

基本信息
资源简介
nAMD-OCT v1.0:新生血管性年龄相关性黄斑变性5,110张OCT B扫描六种结构的像素级标注
nAMD-OCT v1.0: pixel-level annotations of six structures on 5,110 OCT B-scans in neovascular age-related macular degeneration
该数据集包含来自124例未治疗新生血管性年龄相关性黄斑变性患者的5,110张OCT B扫描,由中山大学中山眼科中心采集,并对视网膜下液、视网膜内液、色素上皮脱离、视网膜下高反射物质、外界膜和椭圆体带六种结构进行像素级标注。多数图像使用Heidelberg Spectralis获取,7例患者另用TowardPi扫频光源设备成像。标注由视网膜专家在Labelme中以多边形绘制,部分为手动标注,部分为修正U-Net预标注,并经过审核。该数据可用于OCT图像的语义分割与深度学习模型训练(来源 DOI 解析,restricted access 许可)。
【数据集背景】
源站首次发布:2026。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据集包含来自中国广州中山大学中山眼科中心124例未治疗新生血管性年龄相关性黄斑变性(nAMD)患者的5,110张光学相干断层扫描(OCT)B扫描,并对六种结构进行像素级标注:视网膜下液、视网膜内液、色素上皮脱离、视网膜下高反射物质、外界膜和椭圆体带。大多数B扫描使用Heidelberg Spectralis获取;7例患者另用TowardPi扫频光源设备成像。从黄斑容积扫描和线扫描中为每位患者选取4至134张B扫描以代表病变范围。标注由视网膜专家在Labelme中以多边形绘制,或手动完成(713张B扫描的种子集),或通过修正U-Net预标注完成,所有标注均对照书面p进行审核。
【主题与分类】
主题标签:Clinical medicine、optical coherence tomography、semantic segmentation、subretinal hyperreflective material、ellipsoid zone、deep learning。本站分类:眼及附器疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://www.scidb.cn/detail?dataSetId=4fcb79ba6fce45e7b4d8540f2b8ae45e
使用许可:restricted access。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://doi.org/10.57760/sciencedb.016sf
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含来自124例未接受过治疗的新生血管性年龄相关性黄斑变性(nAMD)患者的光学相干断层扫描(OCT)B扫描图像共5,110幅,患者均在中国广州中山大学中山眼科中心接受检查,并提供了六种结构的像素级标注:视网膜下液、视网膜内液、色素上皮脱离、视网膜下高反射物质、外界膜和椭圆体带。大多数B扫描图像使用Heidelberg Spectralis获取;另有7例患者额外使用TowardPi扫频光源设备成像。从黄斑容积扫描和线扫描中为每例患者选取4至134幅B扫描图像,以代表病变范围。标注由视网膜专科医生在Labelme中以多边形形式绘制,或为手动绘制(包含713幅B扫描图像的种子集),或为对U-Net预标注进行校正后绘制;所有标注在发布前均依据书面方案进行了审核。每幅B扫描图像以769 × 480像素的PNG格式提供,并附有相同尺寸的颜色编码掩膜(共七类,包括背景;见label_map.csv)。
数据按患者层面划分为训练集(100名患者,3,979张B扫描;nAMD-OCT-v1.0_train.zip)和验证集(24名患者,1,131张B扫描;nAMD-OCT-v1.0_val.zip),与相关文章中所用一致。metadata_bscans.csv列出了每张B扫描的文件名、所属划分、匿名患者ID以及各结构的存在情况;metadata_patients.csv列出了每位患者的B扫描数量。文件中包含标注方案(annotation_protocol_v1.0.md)、一份详细说明文件描述和已知局限性的README、使用条款以及SHA-256校验和。没有缺失的图像或掩膜。文件以随机患者代码命名;图像不包含患者标识符,也未提供个体层面的人口统计学或临床数据。已知局限性包括可能遗漏非常小的病灶,以及混浊的视网膜下液与视网膜下色素上皮之间固有的模糊边界。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失?
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