人iPS细胞来源视网膜神经节细胞的RNA-seq
数据为人类iPS细胞（201B7）经改良Sluch等（2017）方案分化至第40天、通过CD90.2/Thy1.2靶向磁珠分选（MACS）获得的视网膜神经节细胞（RGC）的RNA-seq表达谱
基本信息
资源简介
人iPS细胞来源视网膜神经节细胞的RNA-seq
RNA-seq of human iPS cell-derived retinal ganglion cells
该数据集为GSE326418，来源于ncbi.nlm.nih.gov，包含1个文件GSE326418_series_matrix.txt.gz，由Seiya Kanno于2024年3月30日发布。数据为人类iPS细胞（201B7）经改良Sluch等（2017）方案分化至第40天、通过CD90.2/Thy1.2靶向磁珠分选（MACS）获得的视网膜神经节细胞（RGC）的RNA-seq表达谱。研究确认了经典RGC标志物的稳健表达，并发现细胞外基质（ECM）介导信号相关基因显著富集，可用于探究整合素家族在人类RGC中的表达特征及RGC与支架相互作用的分子基础（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Mar 30 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：整合素家族是细胞行为的关键调节因子，通过与细胞外基质（ECM）相互作用传递黏附信号。尽管整合素在视网膜神经节细胞（RGC）存活和神经突生长中起核心作用，但整合素在人类RGC中的全面表达谱仍鲜有表征。本研究对人类iPSC来源的RGC进行RNA测序，以阐明其全局转录组景观。按照改良的Sluch等（2017）方案，从201B7 iPSC分化RGC，并在第40天通过CD90.2/Thy1.2靶向磁珠分选（MACS）分离。我们的分析证实了经典RGC标志物的稳健表达，并揭示了参与ECM介导信号传导的基因显著富集，为RGC-支架相互作用的分子基础提供了新见解。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL28038、9606。本站分类：眼及附器疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE326418
【使用注意】
· 源站最后修改于 Aug 10 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE326418
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
整合素家族是细胞行为的关键调节因子，通过与细胞外基质(ECM)的相互作用传递黏附信号。尽管整合素在视网膜神经节细胞(RGC)存活和神经突生长中起着核心作用，但其在人类RGC中的全面表达谱仍鲜有表征。本研究对源自人类iPSC的RGC进行了RNA测序，以阐明其全局转录组景观。遵循修改后的Sluch等人(2017)方案，我们从201B7 iPSC分化出RGC，并在第40天通过CD90.2/Thy1.2靶向的磁激活细胞分选(MACS)进行分离。我们的分析证实了经典RGC标志物的稳健表达，并揭示了参与ECM介导信号传导的基因显著富集，为RGC-支架相互作用的分子基础提供了新见解。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
