小鼠眼晶状体与全胚胎发育时间进程数据集
该数据集为 GSE32334，来源于 NCBI，包含小鼠胚胎眼晶状体从基板内陷到囊泡形成阶段的微阵列基因表达谱，并设有去除眼部组织的全胚胎对照
基本信息
资源简介
小鼠眼晶状体与全胚胎发育时间进程数据集
Developmental timecourse of mouse ocular lens and whole embryo control
该数据集为 GSE32334，来源于 NCBI，包含小鼠胚胎眼晶状体从基板内陷到囊泡形成阶段的微阵列基因表达谱，并设有去除眼部组织的全胚胎对照。研究者通过比较晶状体与全胚胎表达谱，鉴定差异调控基因，构建晶状体基因富集排序列表，并以 iSyTE 轨迹形式在 UCSC Genome Browser 中展示，用于辅助发现与晶状体功能及白内障相关的基因。数据文件共 1 个，样例为 GSE32334_series_matrix.txt.gz，可用于眼发育与出生缺陷相关基因的筛选与分类研究（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Sep 23 201。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：鉴定参与眼部出生缺陷的基因仍然是一项挑战。为促进与白内障相关基因的鉴定，我们开发了 iSyTE（integrated Systems Tool for Eye gene discovery； 包含小鼠胚胎晶状体从基板内陷阶段过渡到囊泡形成阶段的微阵列基因表达谱。我们通过将晶状体微阵列表达谱与代表去除眼部组织的全胚胎体（WB）的表达谱进行比较，鉴定了差异调控基因。随后利用这些基因生成晶状体基因富集的排序列表，该列表可作为 iSyTE 轨迹在 UCSC Genome browser 中查看，以帮助鉴定具有晶状体功能的基因。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：Expression profiling by array、GPL1261、10090。本站分类：眼及附器疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE32334
【使用注意】
· 源站最后修改于 Feb 11 201，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE32334
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- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
识别参与眼部出生缺陷的基因仍然是一项挑战。为了促进与白内障相关基因的识别，我们开发了iSyTE（整合系统工具用于眼基因发现；http://bioinformatics.udel.edu/Research/iSyTE）。iSyTE包含了小鼠胚胎晶状体从基板内陷阶段过渡到囊泡形成阶段的微阵列基因表达谱。通过将晶状体微阵列表达谱与代表无眼部组织的全胚胎体（WB）表达谱进行比较，我们识别出了差异调控的基因。随后，利用这些基因生成了一个晶状体基因富集的排序列表，该列表可在UCSC基因组浏览器中作为iSyTE轨迹查看，以辅助识别具有晶状体功能的基因。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
