遗传性出血性毛细血管扩张症动静脉畸形中PIEZO1过表达数据集
该数据集来自NCBI GEO,包含内皮特异性Alk1敲除小鼠视网膜及对照的单细胞RNA测序数据,用于研究遗传性出血性毛细血管扩张症(HHT)动静脉畸形(AVM)中的信号通路改变

基本信息
资源简介
遗传性出血性毛细血管扩张症动静脉畸形中PIEZO1过表达数据集
PIEZO1 overexpression in hereditary hemorrhagic telangiectasia arteriovenous malformations
该数据集来自NCBI GEO,包含内皮特异性Alk1敲除小鼠视网膜及对照的单细胞RNA测序数据,用于研究遗传性出血性毛细血管扩张症(HHT)动静脉畸形(AVM)中的信号通路改变。数据覆盖小鼠视网膜内皮细胞的表达谱,并涉及PIEZO1机械敏感离子通道的过表达验证。可用于分析ALK1缺失导致的转录变化、识别AVM相关信号特征,以及评估PIEZO1作为潜在治疗靶点的价值(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:May 27 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):背景:遗传性出血性毛细血管扩张症(HHT)是一种以动静脉畸形(AVM)为特征的遗传性血管疾病。Activin受体样激酶1(ALK1)的功能缺失突变导致2型HHT,Alk1敲除(KO)小鼠会发展出AVM,并伴随VEGFR2/PI3K/AKT信号通路的过度激活。ALK1突变引起的信号改变全貌尚不清楚,需要更有效和特异的抑制剂来对抗患者AVM的形成。方法:对内皮特异性Alk1 KO小鼠视网膜和对照进行单细胞RNA测序。在小鼠和人类HHT2病变中证实了包括机械敏感离子通道PIEZO1在内的流体剪切应力信号特征的过表达。在Alk1 KO小鼠中测试了遗传和药理学PIEZO1抑制,以及下游PIEZO1信号。结果:一个簇
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL21103、10090。本站分类:眼及附器疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE298122
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 19 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
背景:遗传性出血性毛细血管扩张症(HHT)是一种以动静脉畸形(AVMs)为特征的遗传性血管疾病。激活素受体样激酶1(ALK1)的功能缺失突变导致2型HHT,Alk1基因敲除(KO)小鼠会形成AVMs,并伴有VEGFR2/PI3K/AKT信号通路的过度激活。ALK1突变所导致的信号改变全貌尚不清楚,且需要更有效、更特异的抑制剂来对抗患者体内AVM的形成。方法:对血管内皮特异性Alk1 KO小鼠视网膜及对照进行了单细胞RNA测序。在小鼠和人类HHT2病灶中证实了流体剪切应力信号特征(包括机械敏感离子通道PIEZO1)的过表达。在Alk1 KO小鼠中测试了PIEZO1的遗传学和药理学抑制,以及下游PIEZO1信号。结果:一群具有改变的动静脉身份的Alk1突变内皮细胞过表达了与流体剪切应力、缺氧、炎症、细胞周期和VEGFR2/PI3K/AKT信号相关的通路。
在Alk1缺陷小鼠中,Piezo1缺失及药理学抑制减轻了AVM形成,而Piezo1过表达则增强了ALK1配体阻断诱导的AVM形成。机制上,PIEZO1抑制降低了ALK1缺陷内皮中升高的VEGFR2/AKT、ERK5-p62-KLF4、eNOS、缺氧、增殖及炎症。结论:HHT2中PIEZO1表达及信号传导升高。PIEZO1阻断可减少AVM形成并缓解ALK1缺陷细胞的细胞及分子标志性特征。该发现为ALK1相关血管疾病的机制基础提供了新见解,并确定了预防AVM的潜在治疗靶点。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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