白内障手术史供体人晶状体囊RNA-seq分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE295383

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

白内障手术是全球最常实施的眼科手术，但术后晶状体上皮细胞（LECs）的长期分子适应机制仍知之甚少。本研究对来自34名人类供体的晶状体囊膜进行了bulk RNA测序，其中包括17名平均白内障术后7年的供体和17名非白内障对照。差异表达分析显示，术后LECs发生了显著的转录变化，包括1，690个上调基因和579个下调基因。基因集富集分析（GSEA）和基因本体（GO）分析鉴定出氧化应激反应、细胞存活通路和免疫反应特征的激活。总体而言，我们的研究结果揭示，白内障术后LECs经历了深刻而持久的分子重编程，包括炎症性、纤维化、迁移性和衰老性变化。这些适应性改变可能促进后囊膜混浊（PCO）的发生，并为其预防提供了潜在的治疗靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。