出生后42天小鼠富集视网膜神经节细胞的单核水平mRNA和ATAC多组学测序
该数据集提供基于vGlut2纯化的视网膜神经节细胞(RGCs)的单核水平转录组(RNA-seq)和表观基因组(ATAC-seq)数据,样本来自出生后42天(P42)成年小鼠眼睛

基本信息
资源简介
出生后42天小鼠富集视网膜神经节细胞的单核水平mRNA和ATAC多组学测序
single-nuclear level mRNA and ATAC multiome sequencing of enriched retinal ganglion cells from postnatal day 42 mouse
该数据集提供基于vGlut2纯化的视网膜神经节细胞(RGCs)的单核水平转录组(RNA-seq)和表观基因组(ATAC-seq)数据,样本来自出生后42天(P42)成年小鼠眼睛。数据可用于与发育期小鼠RGC或衰老小鼠RGC的其他数据集进行比较,帮助研究RGC在成年阶段的基因表达和染色质可及性特征。数据集包含1个文件,即GSE248868_series_matrix.txt.gz,由C,Qian于2024年11月28日发布,主题涉及高通量测序表达谱分析(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Nov 28 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):此处沉积的数据集提供了基于vGlut2纯化的视网膜神经节细胞(RGCs)的单核水平转录组(RNA-seq)和表观基因组(ATAC-seq),来自P42成年小鼠眼睛,可与其他针对发育期小鼠RGC或衰老小鼠RGC进行的数据集进行比较
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24247、10090。本站分类:眼及附器疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE248868
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jan 03 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
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数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE248868
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
此处存放的数据集提供了基于vGlut2纯化的视网膜神经节细胞(RGCs)的单核水平转录组(RNA-seq)和表观基因组(ATAC-seq),这些数据来自P42成年小鼠的眼睛,可与其他针对发育中小鼠RGCs或衰老小鼠RGCs进行的研究数据集相比较。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络,提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




