出生后42天小鼠富集视网膜神经节细胞的单核水平mRNA和ATAC多组学测序

该数据集提供基于vGlut2纯化的视网膜神经节细胞(RGCs)的单核水平转录组(RNA-seq)和表观基因组(ATAC-seq)数据,样本来自出生后42天(P42)成年小鼠眼睛

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基因组分类GPL2424710090
GSE248868: single-nuclear level mRNA and ATAC multiome sequencing of enriched retinal ganglion cells from postnatal day 42 mouse

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-10

资源简介

出生后42天小鼠富集视网膜神经节细胞的单核水平mRNA和ATAC多组学测序

single-nuclear level mRNA and ATAC multiome sequencing of enriched retinal ganglion cells from postnatal day 42 mouse

该数据集提供基于vGlut2纯化的视网膜神经节细胞(RGCs)的单核水平转录组(RNA-seq)和表观基因组(ATAC-seq)数据,样本来自出生后42天(P42)成年小鼠眼睛。数据可用于与发育期小鼠RGC或衰老小鼠RGC的其他数据集进行比较,帮助研究RGC在成年阶段的基因表达和染色质可及性特征。数据集包含1个文件,即GSE248868_series_matrix.txt.gz,由C,Qian于2024年11月28日发布,主题涉及高通量测序表达谱分析(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Nov 28 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):此处沉积的数据集提供了基于vGlut2纯化的视网膜神经节细胞(RGCs)的单核水平转录组(RNA-seq)和表观基因组(ATAC-seq),来自P42成年小鼠眼睛,可与其他针对发育期小鼠RGC或衰老小鼠RGC进行的数据集进行比较

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24247、10090。本站分类:眼及附器疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE248868

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jan 03 202,引用时请注意版本时效。

下载信息

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      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

此处存放的数据集提供了基于vGlut2纯化的视网膜神经节细胞(RGCs)的单核水平转录组(RNA-seq)和表观基因组(ATAC-seq),这些数据来自P42成年小鼠的眼睛,可与其他针对发育中小鼠RGCs或衰老小鼠RGCs进行的研究数据集相比较。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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